37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2444 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  100 
 
 		 336 aa  639    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2713  integral membrane protein  51.95 
 
 		 479 aa  302  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000899465  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2515  hypothetical protein  32.36 
 
 		 422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.618475  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3816  integral membrane protein  32.37 
 
 		 331 aa  109  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1411  hypothetical protein  29.48 
 
 		 428 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  decreased coverage  0.00790445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  30.63 
 
 		 514 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2333  hypothetical protein  30.19 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0394945  decreased coverage  0.000000641267 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1829  hypothetical protein  28.12 
 
 		 414 aa  95.9  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1442  hypothetical protein  30 
 
 		 439 aa  95.9  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0729346  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  29.77 
 
 		 470 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7595  integral membrane protein  29.47 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.37201  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  32.05 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1239  integral membrane protein  29.97 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  32.05 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  32.05 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2497  hypothetical protein  30.97 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.992932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  25.64 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  27.91 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3907  hypothetical protein  27.12 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837728  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09278  hypothetical protein  25.51 
 
 		 296 aa  69.3  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.237107  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5452  putative transmembrane protein  25.5 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal  0.461593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1340  putative transmembrane protein  28.8 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0762  putative integral membrane protein  27.61 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4250  hypothetical protein  32.14 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13720  transmembrane protein  29.37 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.31543 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0769  hypothetical protein  30.4 
 
 		 390 aa  59.3  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.165359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0453  hypothetical protein  28.62 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977046  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase-like protein  25.91 
 
 		 374 aa  55.8  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0488743  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4818  hypothetical protein  26.84 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4196  hypothetical protein  32.9 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0222519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4810  hypothetical protein  30.23 
 
 		 284 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000731243  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0046  hypothetical protein  32 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2253  hypothetical protein  29.37 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1349  hypothetical protein  33.04 
 
 		 248 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2090  hypothetical protein  46.34 
 
 		 218 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0095  hypothetical protein  38.98 
 
 		 273 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3130  hypothetical protein  33.07 
 
 		 241 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>