More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2087 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2087  ABC transporter related  100 
 
 
282 aa  553  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3196  ABC transporter related  59.01 
 
 
350 aa  312  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2478  ABC transporter related  59.11 
 
 
302 aa  266  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2640  ABC transporter related  47.31 
 
 
278 aa  232  6e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0238  ABC transporter related  50.2 
 
 
268 aa  229  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.904203  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2375  ABC transporter related  45.98 
 
 
271 aa  229  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000193813 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  47.01 
 
 
273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1455  ABC transporter related  45.06 
 
 
259 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1168  ABC transporter related  40.3 
 
 
265 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.463795  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4922  ABC transporter related  42.11 
 
 
303 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35290  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  48.11 
 
 
271 aa  202  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393367  normal  0.462856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0353  ABC transporter related  47.64 
 
 
280 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5319  ABC transporter-related protein  44.23 
 
 
262 aa  198  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.256722 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0327  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.09 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0610  ABC transporter related protein  45.31 
 
 
248 aa  196  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.594594  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0073  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0625  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2459  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2649  ABC transporter related  44.78 
 
 
296 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0689  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.88 
 
 
302 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2517  ABC transporter related  44.78 
 
 
296 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.328547 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0486  ABC transporter related  44.15 
 
 
309 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0680006  hitchhiker  0.00154743 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0603  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.4 
 
 
274 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0755  ABC transporter related  46.4 
 
 
274 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.20195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0985  ABC transporter related protein  46.06 
 
 
263 aa  192  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1028  ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 
290 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0822349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0865  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 
286 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0869  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 
286 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3250  ABC transporter related  41.84 
 
 
313 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.811224  normal  0.498578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5932  ABC heavy metal transporter, ATPase subunit  44.03 
 
 
296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2625  ABC transporter related  43.66 
 
 
296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1991  ABC transporter related  43.66 
 
 
296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2601  ABC transporter related  43.66 
 
 
296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908339  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  42.46 
 
 
271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0696  ABC transporter related  43.4 
 
 
295 aa  188  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.638855 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0293  ABC transporter related  42.75 
 
 
273 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0716  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, ATPase subunit  42.16 
 
 
315 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.905635  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5103  ABC transporter related  40.24 
 
 
257 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4718  ABC transporter related  40.24 
 
 
257 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4804  ABC transporter related  40.24 
 
 
257 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1957  ABC transporter related  43.51 
 
 
281 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  38.15 
 
 
259 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  39.17 
 
 
250 aa  154  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  36.51 
 
 
246 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  34.84 
 
 
254 aa  149  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  33.6 
 
 
256 aa  149  5e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0748  Mn2+/Zn2+ ABC transporter ATPase  35.38 
 
 
296 aa  148  9e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.966679  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0125  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  38.82 
 
 
247 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  36.5 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  36.84 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  37.55 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  32.13 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  37.6 
 
 
243 aa  146  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  37.94 
 
 
271 aa  145  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  35.32 
 
 
258 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  35.66 
 
 
258 aa  145  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  34.7 
 
 
281 aa  144  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  31.71 
 
 
254 aa  144  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  37.04 
 
 
257 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  33.61 
 
 
259 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  38.08 
 
 
262 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  37.97 
 
 
269 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  35.98 
 
 
251 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1231  ABC transporter related  33.72 
 
 
275 aa  142  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  35.47 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  36.59 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  36.55 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  37.55 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  34.84 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  33.6 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  41.92 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  33.47 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  33.47 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  38.11 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  38.99 
 
 
247 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  35.95 
 
 
261 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  29.83 
 
 
249 aa  140  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  38.7 
 
 
268 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50330  iron(III)-siderophore ABC transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 
255 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219188  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  32.65 
 
 
254 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  35.1 
 
 
262 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  35.17 
 
 
253 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  35.17 
 
 
253 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  39.82 
 
 
251 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  35.17 
 
 
253 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1546  ABC transporter related  35.15 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  32.84 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  33.19 
 
 
240 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  29.18 
 
 
258 aa  136  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  30.8 
 
 
236 aa  136  5e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0214  ABC transporter related  37.93 
 
 
250 aa  136  5e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.387521  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0517  manganese transport system ATP-binding protein MntA  34.42 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  37.69 
 
 
278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  34.4 
 
 
311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  37.04 
 
 
250 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  34.63 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  36.4 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  31.84 
 
 
254 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>