More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1096 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  100 
 
 
449 aa  910    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7497  Glutamate--ammonia ligase  61.4 
 
 
445 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1031  L-glutamine synthetase  44.64 
 
 
444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199582  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3850  Glutamate--ammonia ligase  37 
 
 
453 aa  256  8e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274285  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  34.3 
 
 
448 aa  242  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  34.3 
 
 
456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2006  Glutamate--putrescine ligase  35.84 
 
 
449 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.349477  normal  0.804087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  36.5 
 
 
464 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  34.08 
 
 
444 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  34.3 
 
 
444 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  35.49 
 
 
445 aa  230  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  33.18 
 
 
449 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  33.05 
 
 
444 aa  230  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  37.5 
 
 
446 aa  229  9e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  31.91 
 
 
444 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3944  glutamate--putrescine ligase  34.76 
 
 
466 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244314  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  34.08 
 
 
444 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  33.55 
 
 
439 aa  228  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  33.56 
 
 
443 aa  227  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  32.46 
 
 
446 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  32.46 
 
 
442 aa  226  7e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  35.23 
 
 
445 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  33.48 
 
 
446 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  31.71 
 
 
444 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  31.77 
 
 
444 aa  223  4e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  34.88 
 
 
458 aa  223  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  31.4 
 
 
445 aa  223  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  34.19 
 
 
458 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  33.78 
 
 
441 aa  222  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  32.96 
 
 
446 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  35.01 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  35.01 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  33.26 
 
 
446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  35.01 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  33.85 
 
 
430 aa  221  3e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  31.71 
 
 
444 aa  221  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  32.67 
 
 
452 aa  221  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  33.33 
 
 
452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  32.44 
 
 
456 aa  220  5e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  32.39 
 
 
442 aa  220  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  34.42 
 
 
458 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  33.04 
 
 
444 aa  219  6e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  31.95 
 
 
442 aa  219  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  33.48 
 
 
444 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  34.42 
 
 
458 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  32.89 
 
 
443 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1340  Glutamate--putrescine ligase  31.5 
 
 
464 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2079  glutamate--putrescine ligase  34.57 
 
 
445 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114961  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2810  glutamate--ammonia ligase  32.81 
 
 
432 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000780353  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  32.67 
 
 
452 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  34.25 
 
 
444 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  32.29 
 
 
457 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  34.35 
 
 
445 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  32.67 
 
 
452 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  32.67 
 
 
452 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  32.49 
 
 
441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  33.85 
 
 
445 aa  217  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  32.67 
 
 
443 aa  217  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1797  Glutamate--putrescine ligase  32.43 
 
 
455 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  32.88 
 
 
444 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  33.48 
 
 
444 aa  216  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  31.22 
 
 
453 aa  216  7e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  34.32 
 
 
468 aa  216  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  33.91 
 
 
444 aa  216  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0636  glutamine synthetase catalytic domain  33.91 
 
 
444 aa  216  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961715  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  34.19 
 
 
458 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  32.81 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  32.88 
 
 
444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0728  glutamine synthetase catalytic domain  33.91 
 
 
444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  33.95 
 
 
458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2079  L-glutamine synthetase  31.9 
 
 
454 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  36.15 
 
 
456 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  33.41 
 
 
446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  36.32 
 
 
444 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  32.3 
 
 
443 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  29.91 
 
 
445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0295  putative glutamine synthetase  31.93 
 
 
475 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2783  L-glutamine synthetase  31.86 
 
 
450 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  32.65 
 
 
444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2864  glutamate--ammonia ligase  35.43 
 
 
459 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.149371 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  30.48 
 
 
443 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  32.65 
 
 
444 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  32.65 
 
 
444 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  32.65 
 
 
444 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  32.65 
 
 
444 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  32.65 
 
 
444 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  32.07 
 
 
447 aa  213  5.999999999999999e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  34.19 
 
 
458 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  32.52 
 
 
443 aa  213  7e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  33.62 
 
 
456 aa  213  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  32.44 
 
 
452 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  33.95 
 
 
458 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  32.05 
 
 
452 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0377  L-glutamine synthetase  35.56 
 
 
451 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12876  glutamine synthetase glnA4  33.03 
 
 
457 aa  212  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  33.41 
 
 
458 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  31.53 
 
 
433 aa  212  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  32.19 
 
 
439 aa  212  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2654  glutamine synthetase  36.43 
 
 
444 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  32.16 
 
 
452 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>