More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0505 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0505  major facilitator transporter  100 
 
 
437 aa  837    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0170  major facilitator superfamily MFS_1  48.28 
 
 
452 aa  332  7.000000000000001e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1747  major facilitator transporter  53.4 
 
 
449 aa  289  8e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1586  major facilitator transporter  49.27 
 
 
448 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0030166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2259  nitrite extrusion protein, putative  42.31 
 
 
430 aa  247  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2556  major facilitator family transporter  42.27 
 
 
430 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0881  major facilitator transporter  40 
 
 
417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58272 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  31.07 
 
 
441 aa  159  7e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  34.09 
 
 
912 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  33.67 
 
 
895 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  33.25 
 
 
402 aa  153  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 
444 aa  152  8.999999999999999e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  32.39 
 
 
917 aa  152  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  33.84 
 
 
905 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  32.07 
 
 
426 aa  150  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  31.81 
 
 
453 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  29.02 
 
 
389 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  31.45 
 
 
420 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 
435 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  30.71 
 
 
435 aa  144  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  29.88 
 
 
440 aa  144  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  29.88 
 
 
428 aa  144  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  32.71 
 
 
460 aa  144  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  28.78 
 
 
389 aa  143  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  28.78 
 
 
389 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  28.78 
 
 
389 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  28.78 
 
 
389 aa  143  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  28.78 
 
 
389 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  28.78 
 
 
389 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  28.78 
 
 
389 aa  143  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  28.78 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  30.33 
 
 
431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  31.25 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  28.12 
 
 
389 aa  141  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  28.12 
 
 
389 aa  141  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  30.08 
 
 
431 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 
460 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
420 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 
443 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  31.81 
 
 
426 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  31.81 
 
 
426 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  31.84 
 
 
426 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 
417 aa  136  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  28.57 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  28.12 
 
 
387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  32.88 
 
 
459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  29.43 
 
 
436 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  27.64 
 
 
418 aa  133  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 
397 aa  133  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  29.27 
 
 
389 aa  132  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 
438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 
438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  31.83 
 
 
424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 
382 aa  131  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  31.43 
 
 
406 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  31.43 
 
 
406 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  31.43 
 
 
406 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 
413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  31.81 
 
 
409 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 
406 aa  128  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  31.55 
 
 
426 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  31.55 
 
 
426 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  31.55 
 
 
426 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  31.55 
 
 
426 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  27.07 
 
 
431 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  29.43 
 
 
422 aa  124  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
397 aa  123  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  33.09 
 
 
437 aa  123  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 
422 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  29.53 
 
 
404 aa  121  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
398 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  30.28 
 
 
418 aa  121  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  29.57 
 
 
452 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  35.18 
 
 
395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  30.48 
 
 
893 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  33.68 
 
 
421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  29.85 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  26.96 
 
 
424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  33.68 
 
 
421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  30.08 
 
 
390 aa  118  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  31.59 
 
 
472 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  33.61 
 
 
394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  30.79 
 
 
411 aa  116  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  32.3 
 
 
422 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2389  major facilitator transporter  34.74 
 
 
411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  32.18 
 
 
405 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  27.38 
 
 
403 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  28.68 
 
 
403 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  31.65 
 
 
398 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  30.1 
 
 
472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  28.03 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  29.31 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  26.53 
 
 
424 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  31.31 
 
 
401 aa  110  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 
403 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
404 aa  108  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  28.88 
 
 
418 aa  107  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  29.49 
 
 
414 aa  107  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  29.14 
 
 
423 aa  106  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>