22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3368 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3368  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  288  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0355482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3012  hypothetical protein  84.62 
 
 		 144 aa  229  9e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.886275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  74.1 
 
 		 139 aa  215  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  39.34 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  36.5 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6500  PilT domain-containing protein  36.23 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.741915 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  33.58 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  36.76 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  28.37 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4442  PilT domain-containing protein  35.42 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1020  PilT protein domain protein  33.09 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  36.89 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  32.14 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  36.3 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0355  PilT protein  32.37 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.922806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  30.6 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1544  hypothetical protein  32.64 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0195149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0480  PilT protein domain protein  32.62 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3783  hypothetical protein  35.07 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873007  decreased coverage  0.000213032 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1738  PilT protein domain protein  32.41 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000240428  normal  0.135442 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  30.91 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3094  PilT protein-like  33.33 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>