65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1532 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1532  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  478  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2784  hypothetical protein  54.79 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.484233  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1093  hypothetical protein  50.2 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1009  hypothetical protein  49.8 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1160  hypothetical protein  68.42 
 
 		 197 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1939  hypothetical protein  42.48 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172428  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3773  hypothetical protein  43.18 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1209  hypothetical protein  53.59 
 
 		 244 aa  128  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.86891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2825  hypothetical protein  45.7 
 
 		 230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00604868  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2469  putative transmembrane protein  38.14 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1992  hypothetical protein  29.25 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0778906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2114  hypothetical protein  28.63 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141432  normal  0.255263 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2013  hypothetical protein  28.63 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000381426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1962  hypothetical protein  28.63 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784562 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1570  membrane protein  25.33 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.403322  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2208  hypothetical protein  28.57 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224679  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4494  hypothetical protein  28.57 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2418  hypothetical protein  29.72 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0165025  decreased coverage  0.000000160717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2218  hypothetical protein  28.04 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2213  hypothetical protein  28.2 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113796  normal  0.262784 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2163  hypothetical protein  28.2 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2221  hypothetical protein  28.91 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000192671  normal  0.249817 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2357  hypothetical protein  31.36 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02296  hypothetical protein  28.64 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1952  hypothetical protein  26.89 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0282  hypothetical protein  29.68 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1112  putative transmembrane protein  28.17 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.75356  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1290  hypothetical protein  29.07 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1290  hypothetical protein  28.44 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1473  hypothetical protein  28.87 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.068517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2770  putative transmembrane protein  33.72 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226559 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0252  hypothetical protein  36.07 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0945  hypothetical protein  27.08 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2017  hypothetical protein  26.6 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1988  hypothetical protein  28.57 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0203  hypothetical protein  27.03 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2923  hypothetical protein  33.82 
 
 		 225 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2482  hypothetical protein  30 
 
 		 221 aa  53.1  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1046  hypothetical protein  27.14 
 
 		 224 aa  52.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.165842  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1284  hypothetical protein  43.18 
 
 		 248 aa  52.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1049  hypothetical protein  30.7 
 
 		 223 aa  52.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2221  hypothetical protein  25.47 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157963  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0727  hypothetical protein  34.78 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227366  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003474  membrane protein  25.82 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.551919  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0538  hypothetical protein  44.29 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1205  hypothetical protein  28.78 
 
 		 247 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0932  hypothetical protein  26.21 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.748857  normal  0.699875 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1792  hypothetical protein  27.89 
 
 		 229 aa  48.9  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1844  hypothetical protein  27.08 
 
 		 230 aa  48.9  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106534  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0771  hypothetical protein  26.03 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000418366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3048  hypothetical protein  29.64 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1229  hypothetical protein  29.48 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2424  hypothetical protein  28.85 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1095  hypothetical protein  26.63 
 
 		 186 aa  45.4  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.598703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2066  integral membrane protein  26.05 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0675  hypothetical protein  31.94 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2297  ferric reductase domain-containing protein protein transmembrane component domain-containing protein  50 
 
 		 410 aa  43.9  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3422  hypothetical protein  32.74 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.6315  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1959  hypothetical protein  52.08 
 
 		 423 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178526  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1310  hypothetical protein  29.33 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1158  hypothetical protein  51.22 
 
 		 236 aa  42.7  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.102701 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1798  hypothetical protein  26.6 
 
 		 230 aa  42.7  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.442592  normal  0.18393 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0461  putative transmembrane protein  26.42 
 
 		 239 aa  42.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1994  hypothetical protein  32.4 
 
 		 227 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02062  integral membrane protein  25.59 
 
 		 219 aa  42  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>