92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1939 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1939  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  427  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172428  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3773  hypothetical protein  69.78 
 
 		 225 aa  299  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1093  hypothetical protein  43.22 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1209  hypothetical protein  52.07 
 
 		 244 aa  157  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.86891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2784  hypothetical protein  45.19 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.484233  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1009  hypothetical protein  42.8 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1160  hypothetical protein  51.95 
 
 		 197 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1532  hypothetical protein  40.34 
 
 		 261 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2825  hypothetical protein  46.98 
 
 		 230 aa  118  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00604868  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2770  putative transmembrane protein  35.24 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226559 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0945  hypothetical protein  32.98 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1473  hypothetical protein  32.98 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.068517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0771  hypothetical protein  34.04 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000418366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1290  hypothetical protein  30.85 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02296  hypothetical protein  33.52 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003474  membrane protein  32.79 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.551919  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2221  hypothetical protein  31.55 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157963  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2469  putative transmembrane protein  39.22 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2066  integral membrane protein  30.22 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2418  hypothetical protein  33.71 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0165025  decreased coverage  0.000000160717 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1952  hypothetical protein  31.18 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1570  membrane protein  31.89 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.403322  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1290  hypothetical protein  30.53 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2218  hypothetical protein  33.52 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1992  hypothetical protein  31.11 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0778906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2424  hypothetical protein  36.26 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1046  hypothetical protein  30.86 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.165842  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0932  hypothetical protein  34.74 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.748857  normal  0.699875 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1112  putative transmembrane protein  30.31 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.75356  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1049  hypothetical protein  31.94 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0203  hypothetical protein  30.69 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1922  hypothetical protein  29.3 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  29.67 
 
 		 621 aa  63.5  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1310  hypothetical protein  30.81 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2221  hypothetical protein  32.04 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000192671  normal  0.249817 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4494  hypothetical protein  32.04 
 
 		 230 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2208  hypothetical protein  32.04 
 
 		 230 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224679  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0185  hypothetical protein  27.17 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266535  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1792  hypothetical protein  31.25 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1962  hypothetical protein  29.46 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784562 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2013  hypothetical protein  29.46 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000381426 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1844  hypothetical protein  31.64 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106534  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2163  hypothetical protein  32.97 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2213  hypothetical protein  32.97 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113796  normal  0.262784 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2357  hypothetical protein  29.78 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2114  hypothetical protein  30.34 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141432  normal  0.255263 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1815  hypothetical protein  32.99 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.42452  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2017  hypothetical protein  28.96 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1798  hypothetical protein  30.9 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.442592  normal  0.18393 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0850  hypothetical protein  29.24 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0675  hypothetical protein  32.42 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0282  hypothetical protein  28.34 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1988  hypothetical protein  28.37 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2923  hypothetical protein  32.78 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0252  hypothetical protein  32.18 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02062  integral membrane protein  28.57 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157996  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1205  hypothetical protein  29.6 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0461  putative transmembrane protein  32.26 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2083  hypothetical protein  29.77 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000109984  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0727  hypothetical protein  28.19 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227366  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1245  hypothetical protein  25.59 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0538  hypothetical protein  27.68 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2482  hypothetical protein  27.23 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5319  hypothetical protein  29.73 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1284  hypothetical protein  30.65 
 
 		 248 aa  52.4  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1371  hypothetical protein  27.27 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.538624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  30.85 
 
 		 499 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1574  hypothetical protein  25.88 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2414  hypothetical protein  31.89 
 
 		 279 aa  48.5  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0686  hypothetical protein  30.43 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2541  hypothetical protein  25.58 
 
 		 233 aa  48.5  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.832454  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2033  transmembrane protein  30.1 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1355  putative transmembrane protein  32.8 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550104 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1158  hypothetical protein  31.74 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.102701 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1485  hypothetical protein  21.6 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  27.33 
 
 		 471 aa  46.2  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19930  hypothetical protein  30.86 
 
 		 289 aa  46.2  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1666  hypothetical protein  21.6 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.809334  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1841  hypothetical protein  22.22 
 
 		 219 aa  45.8  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1191  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  26.98 
 
 		 409 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3785  hypothetical protein  36.03 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0684997  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3048  hypothetical protein  29.55 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44460  hypothetical protein  35.29 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2612  hypothetical protein  29.76 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.471108  normal  0.594742 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1229  hypothetical protein  30.4 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1143  hypothetical protein  29.61 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00632883  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1994  hypothetical protein  31.06 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3422  hypothetical protein  30.82 
 
 		 249 aa  42  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.6315  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4081  hypothetical protein  32.11 
 
 		 235 aa  42  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0375  hypothetical protein  21.56 
 
 		 221 aa  42  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.767045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0800  hypothetical protein  30.73 
 
 		 263 aa  41.6  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0792  hypothetical protein  27.19 
 
 		 288 aa  41.6  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>