67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1209 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1209  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.86891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3773  hypothetical protein  53.91 
 
 		 225 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2784  hypothetical protein  49.39 
 
 		 238 aa  195  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.484233  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1939  hypothetical protein  51.85 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172428  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1160  hypothetical protein  62.5 
 
 		 197 aa  175  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1093  hypothetical protein  47.06 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1009  hypothetical protein  46.22 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2825  hypothetical protein  52.99 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00604868  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1532  hypothetical protein  45.92 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2770  putative transmembrane protein  37.6 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1049  hypothetical protein  34.8 
 
 		 223 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0461  putative transmembrane protein  30.8 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1290  hypothetical protein  30.58 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2923  hypothetical protein  35.34 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2469  putative transmembrane protein  40.44 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0932  hypothetical protein  30.67 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.748857  normal  0.699875 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02296  hypothetical protein  31.02 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003474  membrane protein  31.77 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.551919  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0203  hypothetical protein  27.57 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0945  hypothetical protein  27.71 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1355  putative transmembrane protein  30.21 
 
 		 239 aa  62  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550104 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0771  hypothetical protein  31.19 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000418366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1290  hypothetical protein  29.8 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1473  hypothetical protein  27.27 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.068517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2424  hypothetical protein  30.21 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1988  hypothetical protein  31.37 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2221  hypothetical protein  29.9 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157963  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1815  hypothetical protein  29.63 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.42452  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1310  hypothetical protein  31.75 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02062  integral membrane protein  29.58 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157996  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2218  hypothetical protein  27.57 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1844  hypothetical protein  27.27 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106534  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0675  hypothetical protein  29.74 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2083  hypothetical protein  29.34 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000109984  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1570  membrane protein  25.65 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.403322  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1798  hypothetical protein  29.74 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.442592  normal  0.18393 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2066  integral membrane protein  27.18 
 
 		 220 aa  52.8  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1112  putative transmembrane protein  27.38 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.75356  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2418  hypothetical protein  27.96 
 
 		 230 aa  52.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0165025  decreased coverage  0.000000160717 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0282  hypothetical protein  28.16 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2357  hypothetical protein  27.13 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2221  hypothetical protein  27.75 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000192671  normal  0.249817 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1952  hypothetical protein  26.6 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2163  hypothetical protein  27.23 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2208  hypothetical protein  27.23 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224679  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4494  hypothetical protein  27.23 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2213  hypothetical protein  27.23 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113796  normal  0.262784 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2013  hypothetical protein  27.23 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000381426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1962  hypothetical protein  27.23 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784562 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1046  hypothetical protein  30 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.165842  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2114  hypothetical protein  27.23 
 
 		 230 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141432  normal  0.255263 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1992  hypothetical protein  27.8 
 
 		 230 aa  49.7  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0778906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2017  hypothetical protein  26.78 
 
 		 229 aa  49.3  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1574  hypothetical protein  26.14 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1205  hypothetical protein  28.12 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1095  hypothetical protein  27.45 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.598703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0538  hypothetical protein  29.51 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1922  hypothetical protein  25.86 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1792  hypothetical protein  29.96 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1371  hypothetical protein  25.63 
 
 		 225 aa  45.4  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.538624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2612  hypothetical protein  37.07 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.471108  normal  0.594742 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2482  hypothetical protein  26.51 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0727  hypothetical protein  30.22 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227366  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44460  hypothetical protein  37.01 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2414  hypothetical protein  28.21 
 
 		 279 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1284  hypothetical protein  37.21 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3785  hypothetical protein  40 
 
 		 227 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0684997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>