35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_11128 on replicon BN001303
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001303  ANIA_11128  RNA polymerase II transcription elongation factor (Ctr9), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G05870)  100 
 
 
1027 aa  2121    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0503014  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72239  protein required for normal CLN1 and CLN2 G1 cyclin expression  28.64 
 
 
1120 aa  345  2.9999999999999997e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0270618 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00490  Pol II transcription elongation factor, putative  26.15 
 
 
1186 aa  248  6e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.84309  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14940  predicted protein  23.09 
 
 
1059 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0306125  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42758  predicted protein  22.47 
 
 
1346 aa  72.4  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.59748  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 
878 aa  62.4  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 
416 aa  52  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.53 
 
 
927 aa  48.9  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  28.76 
 
 
650 aa  48.5  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1188  peptidase S41  30.23 
 
 
897 aa  48.5  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
409 aa  48.1  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.82 
 
 
850 aa  48.1  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 
409 aa  48.1  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 
391 aa  48.1  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
750 aa  47.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.51 
 
 
818 aa  47.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.43 
 
 
639 aa  47.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
544 aa  47  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.15 
 
 
758 aa  46.2  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 
714 aa  45.8  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.66 
 
 
988 aa  45.8  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.81 
 
 
576 aa  45.8  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
1276 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.66 
 
 
784 aa  45.8  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
1421 aa  45.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.9 
 
 
810 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 
402 aa  45.1  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  21.15 
 
 
409 aa  45.1  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.9 
 
 
632 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  25.56 
 
 
1266 aa  44.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.1 
 
 
574 aa  44.7  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  34.88 
 
 
581 aa  44.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.75 
 
 
1056 aa  44.7  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  25.66 
 
 
391 aa  44.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 
169 aa  44.7  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>