More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_09421 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_09421  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  100 
 
 
145 aa  296  7e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.362646  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0882  tRNA-adenosine deaminase  90.34 
 
 
171 aa  277  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09411  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  90.34 
 
 
171 aa  275  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10011  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  73.79 
 
 
165 aa  233  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10241  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  59.59 
 
 
165 aa  189  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.237232 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16461  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  55.94 
 
 
163 aa  183  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0143  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  59.44 
 
 
155 aa  183  8e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07751  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  58.74 
 
 
155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140902  normal  0.0539012 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1262  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  54.48 
 
 
147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1208  tRNA-adenosine deaminase  55.15 
 
 
174 aa  170  5.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.755847 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  41.38 
 
 
147 aa  130  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4089  tRNA-adenosine deaminase  38.46 
 
 
156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  42.34 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  38.46 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.16 
 
 
154 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  37.76 
 
 
153 aa  124  5e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3399  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.16 
 
 
154 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837271  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  38.36 
 
 
149 aa  123  7e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.18 
 
 
151 aa  123  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0190  cytosine deaminase, putative  38.36 
 
 
153 aa  123  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.46 
 
 
156 aa  123  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  39.69 
 
 
160 aa  123  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  40.62 
 
 
144 aa  123  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.18 
 
 
161 aa  121  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.23 
 
 
168 aa  121  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.55 
 
 
165 aa  120  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0208  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.1 
 
 
190 aa  119  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.672477  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
158 aa  118  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.62 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1214  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.36 
 
 
149 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0624  tRNA-adenosine deaminase  38.06 
 
 
153 aa  118  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.81 
 
 
155 aa  118  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.06 
 
 
148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  40.77 
 
 
178 aa  117  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  40.77 
 
 
172 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.5 
 
 
162 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  40.77 
 
 
172 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  37.23 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0650  tRNA-adenosine deaminase  39.84 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4304  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.85 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0110494  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.3 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.94 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  40 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  40 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  40.77 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  40 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  40.77 
 
 
178 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.77 
 
 
167 aa  115  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  40.77 
 
 
178 aa  115  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  40.77 
 
 
178 aa  115  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  40.77 
 
 
167 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  40.77 
 
 
167 aa  115  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  40.77 
 
 
178 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36880  tRNA-adenosine deaminase  35.56 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.699352  normal  0.0665453 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.28 
 
 
152 aa  114  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0202  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.6 
 
 
153 aa  114  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  39.69 
 
 
172 aa  114  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9319  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.61 
 
 
154 aa  113  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  37.14 
 
 
167 aa  113  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.62 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1942  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.31 
 
 
152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.43 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00354903  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0357  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.11 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  40.41 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04500  tRNA-adenosine deaminase  39.5 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.8 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1819  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein, putative  36.99 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000174201  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.67 
 
 
176 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
166 aa  111  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1856  tRNA-adenosine deaminase  38.93 
 
 
168 aa  110  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.489212  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.97 
 
 
151 aa  110  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.71 
 
 
165 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  36.43 
 
 
176 aa  110  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.46 
 
 
179 aa  110  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  38.17 
 
 
169 aa  110  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0534  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.29 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5594  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.12 
 
 
166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  37.23 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.17 
 
 
461 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4048  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.66 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.27 
 
 
175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.27 
 
 
175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.03 
 
 
166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.82 
 
 
231 aa  108  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  36.5 
 
 
159 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.88 
 
 
175 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  37.14 
 
 
155 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.58 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.76 
 
 
154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0088  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.44 
 
 
167 aa  107  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.27 
 
 
174 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  37.06 
 
 
168 aa  107  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  37.06 
 
 
165 aa  107  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
182 aa  107  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
150 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0798  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.04 
 
 
168 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.64 
 
 
157 aa  106  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  36.69 
 
 
137 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.43 
 
 
170 aa  105  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.69 
 
 
158 aa  106  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>