More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1625 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1625  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  303  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2838  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  303  4.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.12042  normal  0.0436846 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1733  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  303  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  53.79 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  55.94 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 162 aa  166  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  51.72 
 
 		 162 aa  166  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 162 aa  166  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  52.45 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  52.45 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 163 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 163 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 163 aa  163  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  52.45 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 145 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 145 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  56.55 
 
 		 154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  50 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6313  AsnC family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 163 aa  153  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2984  AsnC family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 163 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2349  AsnC family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 163 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0434  transcriptional regulator, AsnC family  54.03 
 
 		 156 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2963  AsnC family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 163 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  47.55 
 
 		 153 aa  146  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 173 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  34.33 
 
 		 157 aa  102  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  32.17 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.81 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 153 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 153 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 170 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 170 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  33.1 
 
 		 151 aa  97.4  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 		 157 aa  97.1  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 170 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  33.59 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  29.25 
 
 		 157 aa  94  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 		 158 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  91.7  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2206  transcriptional regulator, AsnC family  36.64 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  31.16 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  31.91 
 
 		 155 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.21 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 168 aa  88.2  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  28.28 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  28.28 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  29.41 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  29.41 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 		 158 aa  86.7  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  30.82 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  31.3 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 171 aa  84  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 171 aa  84  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  30.53 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  30.53 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  30.53 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 150 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 150 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.13 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0267  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481188  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>