57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1337 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1337  curli production assembly/transport component CsgG  100 
 
 		 223 aa  453  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.919367  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1449  curli production assembly/transport component CsgG  100 
 
 		 223 aa  453  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2723  curli production assembly/transport component CsgG  99.55 
 
 		 244 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1390  curli production assembly/transport component CsgG  80.18 
 
 		 223 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4600  Curli production assembly/transport component CsgG  79.73 
 
 		 223 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4279  Curli production assembly/transport component CsgG  80.18 
 
 		 223 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4012  Curli production assembly/transport component CsgG  78.83 
 
 		 223 aa  368  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4221  Curli production assembly/transport component CsgG  77.93 
 
 		 223 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1250  CsgG family protein  72.97 
 
 		 227 aa  338  4e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00570  putative lipoprotein  76.59 
 
 		 228 aa  331  6e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27192  normal  0.120076 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5339  CsgG family protein  70.4 
 
 		 224 aa  330  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1457  curli production assembly/transport component CsgG  74.76 
 
 		 225 aa  326  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0048  putative lipoprotein  76.73 
 
 		 228 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3562  curli production assembly/transport component CsgG  71.3 
 
 		 224 aa  324  6e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0880  outer membrane lipoprotein  70.64 
 
 		 224 aa  319  1.9999999999999998e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01776  lipoprotein  71.84 
 
 		 227 aa  315  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00673998  normal  0.858527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5407  curli production assembly/transport component CsgG  73.08 
 
 		 226 aa  315  5e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1131  curli production assembly/transport component CsgG subfamily protein  65.45 
 
 		 222 aa  302  3.0000000000000004e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00305065  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2759  Curli production assembly/transport component CsgG  68.72 
 
 		 226 aa  301  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2999  curli production assembly/transport component CsgG  71.01 
 
 		 225 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0109  CsgG family protein  68.2 
 
 		 225 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1651  putative curli production assembly/transport component CsgG  68.2 
 
 		 301 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3082  putative curli production assembly/transport component CsgG  68.2 
 
 		 301 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.601979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3467  putative curli production assembly/transport component CsgG  68.2 
 
 		 301 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3889  csgG family protein  68.2 
 
 		 225 aa  298  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.816763  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3970  csgG family protein  68.2 
 
 		 225 aa  298  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3024  curli production assembly/transport component CsgG  69.9 
 
 		 225 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3005  curli production assembly/transport component CsgG  70.39 
 
 		 253 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2391  twin-arginine translocation pathway signal  70.39 
 
 		 253 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2914  curli production assembly/transport component CsgG  70.39 
 
 		 225 aa  295  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49802  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2891  curli production assembly/transport component CsgG, putative  70.94 
 
 		 207 aa  295  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3206  curli production assembly/transport component CsgG, putative  70.44 
 
 		 207 aa  295  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1493  outer membrane lipoprotein  66.67 
 
 		 219 aa  290  1e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0503324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1763  putative curli production assembly/transport component CsgG  31.74 
 
 		 324 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281584  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4121  curli production assembly/transport component CsgG  38.76 
 
 		 323 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0391  curli production assembly/transport component CsgG  39.33 
 
 		 320 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0420  Curli production assembly/transport component CsgG  33.78 
 
 		 321 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0419  Curli production assembly/transport component CsgG  38.29 
 
 		 321 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05526  hypothetical protein  36.91 
 
 		 322 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4674  curli production assembly/transport component CsgG  34.29 
 
 		 337 aa  106  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.501006  normal  0.0721593 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3425  putative lipoprotein  60.53 
 
 		 100 aa  96.7  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3786  hypothetical protein  30.95 
 
 		 321 aa  92.8  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1195  hypothetical protein  26.7 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00195714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1286  Curli production assembly/transport component CsgG  29.32 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.47736  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3644  curli production assembly/transport component CsgG  26.17 
 
 		 340 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1695  hypothetical protein  26.61 
 
 		 332 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01041  hypothetical protein  27.35 
 
 		 277 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.756314  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2608  Curli production assembly/transport component CsgG  27.35 
 
 		 277 aa  44.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0251589  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2096  curli production assembly/transport subunit CsgG  27.35 
 
 		 277 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2562  curli production assembly/transport component CsgG  27.35 
 
 		 277 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.25398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1156  curli production assembly/transport subunit CsgG  27.35 
 
 		 277 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1155  curli production assembly/transport subunit CsgG  27.35 
 
 		 277 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01034  outer membrane lipoprotein  27.35 
 
 		 277 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.743614  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1416  curli production assembly/transport subunit CsgG  27.35 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0591449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4187  hypothetical protein  29.63 
 
 		 574 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0374  Curli production assembly/transport component CsgG  25.32 
 
 		 305 aa  43.9  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0666  curli production assembly/transport component CsgG  25.97 
 
 		 490 aa  43.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>