164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0206 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0206  flagellar protein FliS  100 
 
 
126 aa  259  8e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0656  flagellar protein FliS  96.06 
 
 
127 aa  246  9e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3356  flagellar protein FliS  59.13 
 
 
130 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.385304  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0278  lateral flagellar chaperone protein LafC  58.26 
 
 
130 aa  133  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00844444  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0187  flagellar protein FliS  53.45 
 
 
132 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.158957  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4661  flagellar protein FliS  48.72 
 
 
129 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.227103 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001171  flagellar biosynthesis protein FliS  45.54 
 
 
128 aa  100  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.329244  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04955  flagellin-specific chaperone FliS  43.75 
 
 
128 aa  97.1  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  39.66 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0061  flagellar protein FliS  39.13 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0177  flagellar protein FliS  42.06 
 
 
128 aa  88.6  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.711098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0229  flagellar protein FliS  41.51 
 
 
128 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3453  flagellar protein FliS  42.24 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3954  flagellar protein FliS  42.24 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0846761  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  36.13 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  35.29 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  35.29 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  35.29 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  35.29 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  36.22 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  38.21 
 
 
136 aa  80.5  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2973  flagellar protein FliS  36.54 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126092  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3107  flagellar protein FliS  36.54 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3059  flagellar protein FliS  36.54 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895384  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  40 
 
 
144 aa  77  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  37.17 
 
 
141 aa  77  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  36.54 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  37.5 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6411  flagellar protein FliS  35.58 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.168553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  35.58 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  36.19 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  33.9 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  35.92 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3283  flagellar protein FliS  36.54 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0419  flagellar protein FliS  36.54 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0555717  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2948  flagellar protein FliS  36.54 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2140  flagellar protein FliS  36.54 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0224  flagellar protein FliS  36.54 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204088  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0236  flagellar protein FliS  36.54 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3398  flagellar protein FliS  36.54 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  35.77 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  33.01 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  36.07 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2448  flagellar protein FliS  34.62 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3062  flagellar protein FliS  34.62 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0650828  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3081  flagellar protein FliS  34.62 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  34.95 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  35.25 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  38.83 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  34.96 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  32.38 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0202  flagellar protein FliS  35.58 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  32.38 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
136 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  37.86 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  35.92 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  31.43 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  37.86 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  40.2 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3671  flagellar protein FliS  33.91 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3637  flagellar protein FliS  39.83 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0625  flagellar protein FliS  31.2 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  34.15 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1012  flagellar protein FliS  31.75 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4748  flagellar protein FliS  33.91 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.304458 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1290  hypothetical protein  31.73 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  41.46 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3082  flagellar protein FliS  34.31 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.699542  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  36.89 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  31.07 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  36.52 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  33.98 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0384  flagellar protein FliS  31.3 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1496  flagellar protein FliS  32.46 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0407266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50250  flagellar protein FliS  35.04 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194402  decreased coverage  0.0000900366 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  36.11 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1110  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.218751 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  31.07 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  31.07 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  32.35 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  32.38 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2197  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.66 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  30.1 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  30.48 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  30.48 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  29.13 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  37.5 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3463  flagellar protein FliS  34.96 
 
 
129 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.220279  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  29.2 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1492  flagellar protein FliS  34.43 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  30.69 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  30.1 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4398  flagellar protein FliS  30.39 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  30.1 
 
 
136 aa  60.8  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3585  flagellar protein FliS  28.8 
 
 
126 aa  61.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4375  flagellar protein FliS  33.87 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.837168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1952  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>