More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3369 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  100 
 
 
106 aa  214  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  70.48 
 
 
109 aa  167  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  67.31 
 
 
113 aa  157  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  71.57 
 
 
109 aa  156  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  65.09 
 
 
108 aa  156  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  61.9 
 
 
107 aa  144  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  60.95 
 
 
107 aa  142  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  65 
 
 
108 aa  142  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  58.65 
 
 
115 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  61.39 
 
 
107 aa  138  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  59.22 
 
 
108 aa  136  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  57.43 
 
 
107 aa  135  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  60 
 
 
108 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  60.4 
 
 
107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  58.42 
 
 
107 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  58.42 
 
 
107 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  58.65 
 
 
112 aa  134  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  55.24 
 
 
108 aa  134  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  60 
 
 
108 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  57.84 
 
 
107 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  58.65 
 
 
108 aa  133  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  57.84 
 
 
107 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  56.44 
 
 
107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  57.14 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  63.92 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  56.86 
 
 
107 aa  131  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  54.46 
 
 
107 aa  131  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  61.54 
 
 
109 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  61.54 
 
 
109 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  57.58 
 
 
148 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  61.54 
 
 
109 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  57.84 
 
 
124 aa  130  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  57.84 
 
 
107 aa  130  5e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  59.57 
 
 
107 aa  130  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  59.57 
 
 
107 aa  130  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  57.69 
 
 
107 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  57.69 
 
 
107 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  59.57 
 
 
107 aa  130  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  57.84 
 
 
109 aa  130  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  60.42 
 
 
109 aa  130  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  56.73 
 
 
108 aa  129  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  62 
 
 
109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  57.58 
 
 
106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  60 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  50.48 
 
 
123 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  56.86 
 
 
107 aa  129  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  55.88 
 
 
107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  53.92 
 
 
107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  52.94 
 
 
125 aa  127  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  57.69 
 
 
110 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  51.96 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  54.29 
 
 
112 aa  124  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  51.89 
 
 
107 aa  124  6e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  55 
 
 
108 aa  122  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  61.22 
 
 
109 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  50.94 
 
 
107 aa  122  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  59.77 
 
 
110 aa  121  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  58 
 
 
116 aa  121  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  55.79 
 
 
108 aa  121  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  50 
 
 
110 aa  121  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  50.94 
 
 
107 aa  120  4e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  50.94 
 
 
107 aa  120  4e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  54.46 
 
 
108 aa  121  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  56.12 
 
 
108 aa  121  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  59.34 
 
 
141 aa  120  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  54.74 
 
 
108 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  54.74 
 
 
108 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  55.1 
 
 
108 aa  120  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  50.96 
 
 
113 aa  120  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  54.74 
 
 
108 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  47.62 
 
 
108 aa  120  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  54.74 
 
 
108 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  54.74 
 
 
108 aa  120  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  54.74 
 
 
108 aa  120  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  54.74 
 
 
108 aa  120  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  54.74 
 
 
108 aa  120  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  53.92 
 
 
107 aa  120  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  52.38 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  50.94 
 
 
106 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  55.79 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  50.49 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  52.48 
 
 
112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  57.14 
 
 
116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  52.48 
 
 
112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  54.46 
 
 
106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  56.99 
 
 
106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  50.52 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  56.25 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  55.79 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  55.79 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  52.43 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  53.68 
 
 
108 aa  118  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  49.48 
 
 
108 aa  118  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  53.47 
 
 
108 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  54.74 
 
 
108 aa  118  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  53.47 
 
 
108 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  53.68 
 
 
108 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  50.52 
 
 
106 aa  118  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  55.21 
 
 
107 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>