More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0270 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  100 
 
 
328 aa  612  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  47.22 
 
 
311 aa  231  9e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  45.51 
 
 
317 aa  228  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  51.05 
 
 
303 aa  225  7e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  42.47 
 
 
329 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  49.12 
 
 
346 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  43.03 
 
 
334 aa  216  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  47.64 
 
 
317 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  41.41 
 
 
303 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  47.27 
 
 
317 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  47.27 
 
 
317 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  48.59 
 
 
335 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  42.46 
 
 
316 aa  206  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  45.87 
 
 
300 aa  202  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  48.59 
 
 
310 aa  199  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  43.07 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  38.79 
 
 
306 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  40.25 
 
 
309 aa  192  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  42.76 
 
 
326 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  40.49 
 
 
306 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  38.65 
 
 
316 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  39.8 
 
 
321 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  38.39 
 
 
333 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  37.92 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  41.27 
 
 
311 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  38.46 
 
 
309 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  39.88 
 
 
320 aa  169  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  38.48 
 
 
320 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  41.55 
 
 
312 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  35.29 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  35.67 
 
 
308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  38.72 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  40.12 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  40.21 
 
 
309 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  40.75 
 
 
317 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  30.21 
 
 
315 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  37.68 
 
 
332 aa  156  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  38.62 
 
 
338 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  36.72 
 
 
308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  37.16 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7036  fructokinase  45.69 
 
 
251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  37.58 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  35.58 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  36.59 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  37.58 
 
 
310 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  35.17 
 
 
322 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  40.07 
 
 
313 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  38.23 
 
 
308 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  33.64 
 
 
308 aa  143  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  34.23 
 
 
312 aa  142  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  34.64 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  35.87 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  33.03 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  36.17 
 
 
306 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  33.43 
 
 
308 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 
319 aa  139  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  33.03 
 
 
312 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  35.37 
 
 
306 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  34.47 
 
 
319 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  32.83 
 
 
308 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  36.01 
 
 
322 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  33.03 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  37.2 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  32.83 
 
 
308 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  34.15 
 
 
306 aa  135  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  34.64 
 
 
323 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  32.23 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  34.76 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.48 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  33.43 
 
 
316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  38.08 
 
 
315 aa  129  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  36.7 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  36.62 
 
 
314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  30 
 
 
323 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  35.05 
 
 
307 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  37.15 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  32.25 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  35.07 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  31.36 
 
 
307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  26.09 
 
 
313 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  26.09 
 
 
313 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  33.76 
 
 
319 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  25.93 
 
 
313 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  25.93 
 
 
313 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  35.59 
 
 
323 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  25.93 
 
 
313 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  31.27 
 
 
337 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  27.63 
 
 
319 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  27.63 
 
 
319 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  28.53 
 
 
355 aa  102  6e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  30.86 
 
 
304 aa  102  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  30.56 
 
 
304 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  30.74 
 
 
311 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  34.25 
 
 
316 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  28.36 
 
 
319 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  28.36 
 
 
319 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  37.9 
 
 
319 aa  99.8  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  27.76 
 
 
310 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  25.29 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  24.82 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>