More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4084 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  100 
 
 
470 aa  928    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  59.73 
 
 
471 aa  535  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  60.67 
 
 
471 aa  525  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  58.41 
 
 
473 aa  525  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  59.74 
 
 
471 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  59.65 
 
 
473 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  59.09 
 
 
471 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  58.04 
 
 
470 aa  514  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  61.37 
 
 
473 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  55.7 
 
 
481 aa  501  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  61.28 
 
 
473 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  60.51 
 
 
473 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  60.61 
 
 
472 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  57.68 
 
 
461 aa  453  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  49.89 
 
 
476 aa  428  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  52.25 
 
 
462 aa  405  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  47.27 
 
 
444 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  47.7 
 
 
459 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  47.25 
 
 
462 aa  388  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  45.32 
 
 
485 aa  388  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  46.88 
 
 
471 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  44.16 
 
 
481 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  48.48 
 
 
459 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  44.69 
 
 
479 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  48.28 
 
 
463 aa  368  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2770  putative magnesium transporter  46.61 
 
 
460 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.304585 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3159  magnesium transporter  45.97 
 
 
489 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  38.83 
 
 
445 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0571  magnesium transporter  35.84 
 
 
456 aa  300  3e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  40.43 
 
 
445 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0458  divalent cation transporter  35.58 
 
 
456 aa  296  5e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0375  magnesium transporter  31.45 
 
 
456 aa  295  2e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  40.71 
 
 
453 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  39.91 
 
 
482 aa  286  5e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  37.99 
 
 
453 aa  286  5.999999999999999e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  37.39 
 
 
452 aa  282  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  37.24 
 
 
452 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  39.48 
 
 
453 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  36.64 
 
 
491 aa  280  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  36.64 
 
 
491 aa  280  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  36.64 
 
 
491 aa  280  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  37.56 
 
 
478 aa  280  5e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  37.53 
 
 
422 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  39.22 
 
 
494 aa  272  8.000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  34.91 
 
 
454 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  39.41 
 
 
452 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  34.08 
 
 
454 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  35.14 
 
 
454 aa  272  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  35.14 
 
 
454 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  35.14 
 
 
454 aa  272  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  36.24 
 
 
479 aa  271  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  36.04 
 
 
453 aa  271  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  36.23 
 
 
480 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  34.17 
 
 
480 aa  270  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  33.78 
 
 
454 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  35.55 
 
 
455 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  33.63 
 
 
454 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  36.47 
 
 
480 aa  269  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  35.15 
 
 
454 aa  269  7e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  33.85 
 
 
454 aa  269  8e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  36.82 
 
 
454 aa  269  8e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  35.75 
 
 
480 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  34 
 
 
454 aa  268  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  33.85 
 
 
454 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  36.9 
 
 
477 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  37.05 
 
 
480 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  35.82 
 
 
482 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  35.82 
 
 
482 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  35.99 
 
 
480 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  37.05 
 
 
453 aa  264  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  35.99 
 
 
480 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  35.99 
 
 
480 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  32.96 
 
 
454 aa  264  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  36.23 
 
 
480 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  36.82 
 
 
453 aa  263  4e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  36.34 
 
 
451 aa  263  6.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  37.29 
 
 
451 aa  262  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  37.32 
 
 
450 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  35.73 
 
 
481 aa  260  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  33.65 
 
 
454 aa  260  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  35.87 
 
 
452 aa  259  6e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  37.09 
 
 
442 aa  258  1e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  37.83 
 
 
481 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1626  magnesium transporter  38.81 
 
 
454 aa  258  2e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  38.15 
 
 
450 aa  258  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  35.88 
 
 
452 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  34.92 
 
 
449 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  34.03 
 
 
461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  36.89 
 
 
444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  37.62 
 
 
452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1855  magnesium transporter  37.2 
 
 
450 aa  253  5.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647183  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  33.57 
 
 
451 aa  252  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1332  magnesium transporter  36.95 
 
 
455 aa  251  3e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  38.98 
 
 
455 aa  249  6e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  36.06 
 
 
492 aa  249  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0725  magnesium transporter  34.86 
 
 
484 aa  248  2e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0465  magnesium transporter  38.86 
 
 
437 aa  248  2e-64  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  34.23 
 
 
451 aa  243  3.9999999999999997e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  32.25 
 
 
461 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  32.25 
 
 
461 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>