121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2447 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2447  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  511  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  65.22 
 
 
258 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0743  hypothetical protein  57.77 
 
 
257 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848227  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1704  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  60.48 
 
 
262 aa  259  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.332773  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2243  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  60.08 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241494  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1631  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  60.32 
 
 
262 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.995531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  48.24 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0910  hypothetical protein  46.74 
 
 
261 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4668  hypothetical protein  42.8 
 
 
266 aa  182  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9016  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  41.38 
 
 
259 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  0.212694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1532  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  46.12 
 
 
254 aa  178  8e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2782  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  45.24 
 
 
256 aa  176  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.674441  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0065  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  42.91 
 
 
264 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5751  hypothetical protein  35.52 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  30.18 
 
 
295 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  28.15 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2954  Beta-lactamase-like  29.62 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938277  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  26.88 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2477  exported protein  34 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102477  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2498  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0684369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2548  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4235  beta-lactamase-like protein  31.79 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4915  putative Zn-dependent hydrolase of beta- lactamase fold family  32.07 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  26.89 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  30.74 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10421  conserved hypothetical protein  23.43 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.876476 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03523  conserved hypothetical protein  24.26 
 
 
340 aa  67  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.077158  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3185  hypothetical protein  27.43 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  28.97 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1858  hypothetical protein  27.94 
 
 
293 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00276087  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1801  beta-lactamase  30 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.204896  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  29.23 
 
 
344 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1482  hypothetical protein  24.21 
 
 
201 aa  63.5  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  31.19 
 
 
388 aa  62  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  26.8 
 
 
324 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  26.8 
 
 
324 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  27.92 
 
 
423 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  26.8 
 
 
324 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3459  hypothetical protein  22.35 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0233834 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  25.74 
 
 
324 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1365  putative secreted protein  27.57 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  27.91 
 
 
361 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  26.8 
 
 
324 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  28.08 
 
 
325 aa  60.1  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  22.14 
 
 
296 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  27.14 
 
 
324 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  30.19 
 
 
358 aa  59.3  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0526  beta-lactamase domain protein  26 
 
 
298 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  28.52 
 
 
332 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  26.32 
 
 
336 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.28 
 
 
590 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  30.39 
 
 
362 aa  57  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  24.74 
 
 
324 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  27.47 
 
 
331 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2597  beta-lactamase-like protein  26.51 
 
 
299 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  28.06 
 
 
332 aa  55.8  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  27.48 
 
 
334 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000899  membrane protein  26.4 
 
 
414 aa  55.8  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  24.75 
 
 
324 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  24.75 
 
 
324 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2326  hypothetical protein  25.12 
 
 
309 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0500468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  26.41 
 
 
336 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  24.1 
 
 
324 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0420  beta-lactamase fold protein  24.57 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00386164  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  26.11 
 
 
392 aa  53.1  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  29.9 
 
 
363 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03400  hypothetical protein  21.65 
 
 
366 aa  52  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  29.51 
 
 
363 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1021  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  41.77 
 
 
312 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  31.02 
 
 
358 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  24.08 
 
 
376 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.21 
 
 
374 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2243  hypothetical protein  32.8 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  0.828679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  25.37 
 
 
358 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  25.11 
 
 
335 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  31.15 
 
 
374 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  31.15 
 
 
374 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  25.14 
 
 
362 aa  50.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.5 
 
 
353 aa  49.7  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.81 
 
 
374 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.21 
 
 
374 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  25.82 
 
 
368 aa  48.9  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  29.95 
 
 
374 aa  48.9  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 
330 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  35.92 
 
 
350 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  28.34 
 
 
403 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.4 
 
 
380 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4971  beta-lactamase domain-containing protein  23.28 
 
 
255 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  30.27 
 
 
374 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  38.96 
 
 
396 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.55 
 
 
354 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  24.59 
 
 
356 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 
367 aa  46.2  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  25.83 
 
 
376 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  25.68 
 
 
364 aa  45.8  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  28.64 
 
 
360 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  32.74 
 
 
362 aa  45.4  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  25.91 
 
 
358 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0722  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.79 
 
 
304 aa  44.7  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.669338  hitchhiker  0.0000193421 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>