37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0910 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0910  appr-1-p processing domain-containing protein  100 
 
 
356 aa  728    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998324  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5129  hypothetical protein  74.72 
 
 
362 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0566  appr-1-p processing domain-containing protein  73.45 
 
 
360 aa  534  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315958  decreased coverage  0.00000000000000126999 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  65.81 
 
 
355 aa  457  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  63.66 
 
 
362 aa  449  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  40.81 
 
 
352 aa  249  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  40.06 
 
 
349 aa  246  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  47 
 
 
354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2198  Appr-1-p processing domain protein  42.81 
 
 
351 aa  243  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  42.7 
 
 
346 aa  241  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  40.72 
 
 
351 aa  239  6.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1715  appr-1-p processing domain-containing protein  43.32 
 
 
397 aa  237  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00091392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  40.11 
 
 
345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  39.11 
 
 
353 aa  233  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  46.3 
 
 
345 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  46.69 
 
 
357 aa  233  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  40.71 
 
 
331 aa  225  8e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1468  hypothetical protein  38.2 
 
 
353 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  36.48 
 
 
341 aa  180  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  50 
 
 
150 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  43.06 
 
 
242 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1300  hypothetical protein  46.28 
 
 
136 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  32.32 
 
 
392 aa  91.3  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0073  hypothetical protein  32.28 
 
 
393 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000146563  unclonable  0.00000000120063 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1810  Appr-1-p processing enzyme  31.51 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.175893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  31.58 
 
 
163 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  27.04 
 
 
168 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  26.14 
 
 
158 aa  63.2  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  26.42 
 
 
168 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4411  Appr-1-p processing domain protein  29.17 
 
 
152 aa  59.3  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  27.97 
 
 
146 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0081  hypothetical protein  25.89 
 
 
190 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.71142  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1160  appr-1-p processing domain-containing protein  28.38 
 
 
167 aa  47.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.429654  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0960  Appr-1-p processing  25.81 
 
 
179 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2786  Appr-1-p processing  25.87 
 
 
152 aa  47.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3357  Appr-1-p processing domain protein  25.95 
 
 
162 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3492  Appr-1-p processing domain protein  25.17 
 
 
179 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>