More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3526 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 421 aa  830    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1411  major facilitator superfamily transporter  83.54 
 
 		 433 aa  642    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  73.02 
 
 		 403 aa  608  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  72.93 
 
 		 418 aa  584  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  69.52 
 
 		 418 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  64.1 
 
 		 416 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  63.57 
 
 		 418 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  61.67 
 
 		 419 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  62.29 
 
 		 439 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  63.31 
 
 		 421 aa  514  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  62.29 
 
 		 419 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  40.92 
 
 		 403 aa  292  6e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  40.95 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  41.58 
 
 		 417 aa  282  7.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  40.45 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  40.91 
 
 		 403 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  39.39 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  41.78 
 
 		 400 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  41.21 
 
 		 411 aa  268  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  39.25 
 
 		 404 aa  268  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  40.66 
 
 		 403 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  40.86 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  40.2 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  42.07 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  40.56 
 
 		 403 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  40.56 
 
 		 411 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1603  nitrite transporter  40.31 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966318  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 423 aa  244  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  37.44 
 
 		 403 aa  243  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1735  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  38.87 
 
 		 403 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41510  nitrate transporter  37.91 
 
 		 403 aa  236  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3522  nitrate transporter  37.4 
 
 		 403 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0594  nitrate transporter, putative  32.86 
 
 		 424 aa  206  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1986  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.53952 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2211  major facilitator superfamily nitrate/nitrite transporter NarK/NasA  33.1 
 
 		 455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 420 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 389 aa  156  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 389 aa  156  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  27.82 
 
 		 431 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  29.27 
 
 		 424 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 394 aa  150  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 424 aa  149  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  33.08 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  33.08 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 		 395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  27.3 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  27.02 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 389 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  27.02 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  27.02 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  27.02 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  27.02 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 418 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 440 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  27.02 
 
 		 389 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  27.02 
 
 		 389 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 389 aa  143  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  29.75 
 
 		 426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  29.92 
 
 		 387 aa  139  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  31.12 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  29.48 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  29.48 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 403 aa  137  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  27.98 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  27.34 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  26.77 
 
 		 435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  26 
 
 		 905 aa  134  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 438 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 438 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 444 aa  132  9e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 		 460 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  33.46 
 
 		 424 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 472 aa  130  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 397 aa  130  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 402 aa  129  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  28.09 
 
 		 417 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  33.08 
 
 		 424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  27.99 
 
 		 895 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  33.08 
 
 		 424 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  27.75 
 
 		 912 aa  126  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 420 aa  126  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 424 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  31.48 
 
 		 424 aa  124  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  29.48 
 
 		 426 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  29.48 
 
 		 426 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>