More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1097 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1097  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 337 aa  696    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  54.87 
 
 		 341 aa  391  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  54.57 
 
 		 341 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  54.57 
 
 		 342 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  56.11 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1363  extracellular solute-binding protein  50.89 
 
 		 340 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.634696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6061  extracellular solute-binding protein family 1  53.64 
 
 		 342 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  51.51 
 
 		 341 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  52.7 
 
 		 342 aa  360  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4977  extracellular solute-binding protein family 1  51.08 
 
 		 347 aa  346  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  48.36 
 
 		 343 aa  324  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6060  extracellular solute-binding protein family 1  47.27 
 
 		 340 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  47.2 
 
 		 343 aa  309  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1991  extracellular solute-binding protein family 1  45.85 
 
 		 342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000248153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1762  extracellular solute-binding protein family 1  46.29 
 
 		 340 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66245  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  47.69 
 
 		 343 aa  303  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0643  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  47.43 
 
 		 346 aa  300  2e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121089  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  43.28 
 
 		 344 aa  289  6e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1366  extracellular solute-binding protein family 1  45.08 
 
 		 344 aa  285  7e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1772  extracellular solute-binding protein family 1  44.13 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.320595  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2485  extracellular solute-binding protein family 1  43.93 
 
 		 343 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.390798  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0641  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  44.01 
 
 		 343 aa  269  4e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147653  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  41.37 
 
 		 342 aa  225  9e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2993  extracellular solute-binding protein family 1  36.05 
 
 		 350 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1638  iron ABC transporter substrate-binding protein  39.26 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4649  extracellular solute-binding protein  35.31 
 
 		 335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4473  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  32.82 
 
 		 341 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144148 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0009  extracellular solute-binding protein family 1  34.86 
 
 		 379 aa  172  9e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.892782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4607  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  32.82 
 
 		 341 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.980284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1282  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  34.55 
 
 		 347 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  31.66 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.33 
 
 		 347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5525  extracellular solute-binding protein  34.66 
 
 		 340 aa  156  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1237  extracellular metal-binding protein  32.7 
 
 		 358 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2899  extracellular solute-binding protein  36.32 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00994055 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1436  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  30.91 
 
 		 346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1235  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  30.91 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1212  iron ABC transporter solute-binding protein  30.91 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1214  iron ABC transporter solute-binding protein  30.91 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1337  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  30.91 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1411  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.91 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 343 aa  152  7e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3970  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.6 
 
 		 358 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1476  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.6 
 
 		 358 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1374  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.28 
 
 		 358 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5874  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 341 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2917  extracellular solute-binding protein family 1  30.41 
 
 		 339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1048  extracellular solute-binding protein  31.55 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1545  extracellular solute-binding protein family 1  30.12 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.061269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0330  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  30.38 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.631264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5188  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  30.38 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5008  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5367  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5135  ABC transporter, periplasmic binding protein  29.75 
 
 		 341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.659918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0970  extracellular solute-binding protein  31.69 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000273849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000766  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.38 
 
 		 336 aa  139  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.86 
 
 		 339 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.001131  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04877  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  29.38 
 
 		 336 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4694  extracellular solute-binding protein  31.12 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  31.56 
 
 		 364 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2746  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  30.66 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.553799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.4 
 
 		 338 aa  129  7.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0811  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 		 351 aa  129  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04090  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  27.08 
 
 		 367 aa  122  7e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.510256 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  29.49 
 
 		 378 aa  122  7e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3135  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  31.56 
 
 		 351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  29.79 
 
 		 325 aa  115  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6494  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  30.67 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000128013  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3159  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  31.11 
 
 		 351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451295  normal  0.0280644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5376  putative lipoprotein  35.55 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5430  putative lipoprotein  35.07 
 
 		 344 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0223  hypothetical protein  33.49 
 
 		 339 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4956  ABC transporter substrate-binding protein  34.6 
 
 		 344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5110  putative lipoprotein  34.12 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4941  ABC transporter substrate-binding protein  34.12 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5501  putative lipoprotein  34.12 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5350  putative lipoprotein  34.12 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5052  putative lipoprotein  34.12 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0223  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  32.11 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2031  ABC-type transporter, periplasmic component  28.79 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.702659  hitchhiker  0.000664756 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3071  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.49 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0652  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.49 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1412  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.49 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0501  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.49 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1419  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.37 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1215  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.49 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0399502  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.49 
 
 		 844 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2025  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.727103  hitchhiker  0.0000000026678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5871  extracellular solute-binding protein family 1  28.62 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2829  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.03 
 
 		 353 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1117  extracellular solute-binding protein  32.42 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2074  extracellular solute-binding protein  32.42 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5572  putative lipoprotein  33.49 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5382  putative lipoprotein  33.49 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1116  extracellular solute-binding protein  32.03 
 
 		 361 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1485  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 470 aa  102  6e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0472403  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4343  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  32.03 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  29.69 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>