More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0706 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0706  putative glucokinase  100 
 
 
311 aa  630  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.660435  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2047  ROK family protein  41.88 
 
 
297 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2334  ROK family protein  41.23 
 
 
297 aa  221  9e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  37.97 
 
 
292 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  38.61 
 
 
292 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  37.97 
 
 
292 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  37.97 
 
 
292 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  37.97 
 
 
292 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  38.96 
 
 
292 aa  192  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  37.66 
 
 
292 aa  192  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  37.38 
 
 
292 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  38.26 
 
 
292 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1072  ROK family protein  34.41 
 
 
312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  36.86 
 
 
292 aa  189  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1636  transcriptional regulator/sugar kinase  35.1 
 
 
300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.582275  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0383  ROK family protein  36.89 
 
 
292 aa  163  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0961  ROK family protein  31.56 
 
 
298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  30.62 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0040  ROK family protein  30.94 
 
 
293 aa  142  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  28.94 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  29.45 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1680  transcriptional regulator  31.3 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  28.53 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0197  transcriptional regulator/sugar kinase  31.67 
 
 
313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000610639  normal  0.262374 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  30.47 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0152  ROK family protein  30.55 
 
 
290 aa  125  9e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3959  putative transcriptional regulator  28.38 
 
 
293 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229726  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3880  putative transcriptional regulator  28.38 
 
 
293 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  27.3 
 
 
315 aa  122  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4004  putative transcriptional regulator  28.38 
 
 
293 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.542016 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3895  putative transcriptional regulator  28.38 
 
 
293 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4066  putative transcriptional regulator  28.05 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.407658  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  28.71 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  27.63 
 
 
393 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  26.3 
 
 
319 aa  115  8.999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  26.47 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  25.5 
 
 
311 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  28.53 
 
 
327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  28.53 
 
 
327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  27.74 
 
 
327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  24.92 
 
 
347 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  30.5 
 
 
322 aa  109  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  28 
 
 
313 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  26.3 
 
 
297 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  26.3 
 
 
297 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  31.03 
 
 
303 aa  109  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  25.24 
 
 
323 aa  108  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  28.62 
 
 
327 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  28.62 
 
 
327 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  28.62 
 
 
327 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  28.62 
 
 
327 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  28.62 
 
 
327 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  28.62 
 
 
327 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  28.62 
 
 
327 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  25.89 
 
 
393 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  29.25 
 
 
327 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  29.06 
 
 
302 aa  105  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  25.39 
 
 
342 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  24.2 
 
 
304 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  30.47 
 
 
283 aa  104  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  24.2 
 
 
304 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  24.92 
 
 
321 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  24.09 
 
 
318 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  29.64 
 
 
313 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  30.18 
 
 
317 aa  102  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  25.48 
 
 
321 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  26.91 
 
 
320 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  28.78 
 
 
306 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2004  N-acetyl-D-glucosamine kinase  24.92 
 
 
306 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  27.99 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  26.47 
 
 
393 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  23.64 
 
 
303 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  23.64 
 
 
303 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  23.64 
 
 
303 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  23.64 
 
 
303 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  23.64 
 
 
303 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  24.92 
 
 
335 aa  99.4  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  25.32 
 
 
316 aa  99.4  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  26.5 
 
 
313 aa  99.4  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  23.64 
 
 
303 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  26.07 
 
 
302 aa  99  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  25.64 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2459  ROK family protein  25.75 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0122294  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0299  ROK family protein  28.34 
 
 
286 aa  98.2  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0306  ROK family protein  28.34 
 
 
286 aa  98.2  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  23.72 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  23.76 
 
 
396 aa  96.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  26.96 
 
 
305 aa  96.3  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  25.41 
 
 
313 aa  95.1  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1710  ROK family protein  27.74 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  27.08 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  26.73 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  26.73 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  27.16 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  27.85 
 
 
361 aa  93.6  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  24.52 
 
 
313 aa  92.8  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  27.61 
 
 
322 aa  92.8  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0731  transcriptional regulator/sugar kinase  30 
 
 
302 aa  92.4  8e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149546  normal  0.155714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  21.22 
 
 
400 aa  92.4  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01960  transcriptional regulator/sugar kinase  24.56 
 
 
322 aa  92  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.739718  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>