73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02993 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1861  sodium/proton antiporter  79.68 
 
 
442 aa  677    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02993  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  848    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0526  hypothetical protein  85.85 
 
 
441 aa  739    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0887  Na+/H+ antiporter NhaC  75.23 
 
 
446 aa  640    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801907  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002937  hypothetical protein  95.06 
 
 
425 aa  801    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000304263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1515  Na+/H+ antiporter NhaC  66.59 
 
 
439 aa  568  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000563518  normal  0.487296 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2757  hypothetical protein  67.29 
 
 
439 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2449  Na+/H+ antiporter NhaC  68.06 
 
 
439 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00774297  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2377  Na+/H+ antiporter NhaC  67.82 
 
 
439 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00605411  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2542  Na+/H+ antiporter NhaC  66.59 
 
 
439 aa  559  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000174807  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2575  Na+/H+ antiporter NhaC  64.73 
 
 
439 aa  553  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000723865  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1737  Na+/H+ antiporter NhaC  66.36 
 
 
439 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000126474  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1776  Na+/H+ antiporter NhaC  66.36 
 
 
439 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000109905  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2547  Na+/H+ antiporter NhaC  66.36 
 
 
439 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000475833  hitchhiker  0.0000000305197 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1733  Na+/H+ antiporter NhaC  66.36 
 
 
439 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000745905  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2092  Na+/H+ antiporter NhaC  65.37 
 
 
445 aa  549  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000144395  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2095  hypothetical protein  65.51 
 
 
440 aa  548  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1454  Na+/H+ antiporter NhaC  65.2 
 
 
442 aa  545  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1847  Na+/H+ antiporter NhaC  66.13 
 
 
439 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1598  Na+/H+ antiporter NhaC  65.89 
 
 
439 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000151079  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0056  Na+/H+ antiporter NhaC  61.25 
 
 
440 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.455554  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1068  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  66.13 
 
 
440 aa  533  1e-150  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2742  Na+/H+ antiporter NhaC  63.81 
 
 
439 aa  522  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000444326  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1014  permease  57.5 
 
 
452 aa  504  1e-141  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.747204  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1651  Na+/H+ antiporter NhaC  60.5 
 
 
448 aa  502  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00196781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3845  Na+/H+ antiporter  55.22 
 
 
439 aa  474  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4012  hypothetical protein  54.76 
 
 
439 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4325  hypothetical protein  54.76 
 
 
439 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4127  hypothetical protein  54.99 
 
 
439 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00423015 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2802  Na+ antiporter NhaC  55.32 
 
 
439 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.936373  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3935  Na+/H+ antiporter NhaC  55.68 
 
 
439 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.10264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4172  hypothetical protein  55.68 
 
 
439 aa  464  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3859  Na+/H+ antiporter  54.99 
 
 
439 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29770  putative transporter  60.42 
 
 
441 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000647538  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1024  hypothetical protein  55.56 
 
 
439 aa  464  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4213  hypothetical protein  55.79 
 
 
439 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2547  putative transporter  60.19 
 
 
441 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4236  hypothetical protein  54.99 
 
 
439 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2218  Na+/H+ antiporter NhaC  58.24 
 
 
439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1978  Na+/H+ antiporter NhaC  53.3 
 
 
464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.331673 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1898  Na+/H+ antiporter NhaC  54.04 
 
 
453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0935892  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3556  Na+/H+ antiporter NhaC  58.24 
 
 
439 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2366  Na+/H+ antiporter NhaC  58.7 
 
 
439 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2075  Na+/H+ antiporter NhaC  58.24 
 
 
439 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.355597  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3769  Na+/H+ antiporter NhaC  58.24 
 
 
438 aa  443  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1999  Na+/H+ antiporter NhaC  59.86 
 
 
439 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00435268  normal  0.0272999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0943  Na+ antiporter NhaC  48.17 
 
 
448 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.629306  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0962  Na+ antiporter NhaC  48.26 
 
 
438 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000234758  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1343  Na+/H+ antiporter NhaC  46.56 
 
 
438 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014842  hitchhiker  0.000383483 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0943  Na+/H+ antiporter NhaC  48.26 
 
 
438 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000851242  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2204  Na+/H+ antiporter family protein  50.93 
 
 
433 aa  382  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000124721  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0529  hypothetical protein  47.1 
 
 
438 aa  384  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0114104  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1758  transport protein  47.7 
 
 
432 aa  375  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1749  transport protein  47.07 
 
 
435 aa  359  6e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2039  transport protein  47.25 
 
 
455 aa  350  2e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0477  Na+/H+ antiporter NhaC  49.16 
 
 
434 aa  344  1e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0558  Na+/H+ antiporter family protein  45.14 
 
 
446 aa  327  3e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000048202 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0006  Na+/H+ antiporter family protein  44.32 
 
 
433 aa  320  3e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0435713  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0006  Na+/H+ antiporter family protein  44.08 
 
 
433 aa  318  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000950539  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0032  Na+/H+ antiporter family protein  44.08 
 
 
433 aa  311  1e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.540321  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1865  citrate transporter  44.27 
 
 
455 aa  298  9e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1540  Na+/H+ antiporter family protein  42.5 
 
 
450 aa  279  8e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  29.11 
 
 
571 aa  53.5  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  29.11 
 
 
571 aa  53.1  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  28.37 
 
 
517 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  28.77 
 
 
557 aa  47  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  27.17 
 
 
567 aa  46.6  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  28.57 
 
 
567 aa  46.6  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  28.17 
 
 
570 aa  45.8  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1163  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  25.65 
 
 
441 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.963598 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1204  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  28.65 
 
 
427 aa  44.7  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  25.58 
 
 
507 aa  43.5  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  26.8 
 
 
569 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>