271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002634 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  100 
 
 
326 aa  669    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  87.73 
 
 
326 aa  599  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  72.09 
 
 
328 aa  502  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  63.04 
 
 
322 aa  434  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  55.87 
 
 
326 aa  312  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  55.87 
 
 
326 aa  312  3.9999999999999997e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  55.52 
 
 
326 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  54.23 
 
 
322 aa  309  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  54.23 
 
 
322 aa  309  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  54.23 
 
 
322 aa  309  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  54.23 
 
 
322 aa  309  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  54.23 
 
 
322 aa  309  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  54.23 
 
 
322 aa  309  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  54.23 
 
 
322 aa  309  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  55.16 
 
 
325 aa  309  4e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  54.23 
 
 
322 aa  309  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  52.82 
 
 
322 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  53.52 
 
 
322 aa  306  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  52.82 
 
 
322 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  52.82 
 
 
322 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  52.82 
 
 
322 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  52.82 
 
 
322 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  53.17 
 
 
322 aa  305  5.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  51.75 
 
 
325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  51.93 
 
 
325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  56.76 
 
 
325 aa  300  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  54.44 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  55.7 
 
 
357 aa  263  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  54.15 
 
 
317 aa  259  4e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  59.91 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1223  phosphoserine phosphatase  55.72 
 
 
330 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2817  phosphoserine phosphatase SerB  54.68 
 
 
331 aa  232  6e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  45.66 
 
 
369 aa  230  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1032  phosphoserine phosphatase SerB  56.5 
 
 
348 aa  228  8e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3223  phosphoserine phosphatase SerB  52.27 
 
 
326 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3222  phosphoserine phosphatase SerB  52.27 
 
 
326 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1145  phosphoserine phosphatase SerB  52.27 
 
 
326 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000532777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  51.82 
 
 
326 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3043  phosphoserine phosphatase SerB  52.27 
 
 
335 aa  225  9e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1107  phosphoserine phosphatase  53.73 
 
 
330 aa  225  9e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829453 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1042  phosphoserine phosphatase  53.73 
 
 
330 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1046  phosphoserine phosphatase  53.73 
 
 
330 aa  223  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3544  phosphoserine phosphatase SerB  55.56 
 
 
326 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0084049 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0978  phosphoserine phosphatase  54.73 
 
 
316 aa  220  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2810  phosphoserine phosphatase SerB  55.56 
 
 
327 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  42.86 
 
 
410 aa  218  7.999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  47.86 
 
 
327 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1007  phosphoserine phosphatase SerB  52.63 
 
 
328 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3373  phosphoserine phosphatase  49.78 
 
 
330 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.381097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  46.78 
 
 
410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  51.21 
 
 
405 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  45.67 
 
 
404 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  47.64 
 
 
404 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  48.02 
 
 
418 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  47.01 
 
 
398 aa  209  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  49.1 
 
 
413 aa  209  5e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  47.64 
 
 
429 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  47.79 
 
 
418 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  47.77 
 
 
404 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  50.91 
 
 
411 aa  206  6e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  46.78 
 
 
429 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  51.96 
 
 
406 aa  205  8e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  44.36 
 
 
432 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  48.02 
 
 
438 aa  204  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  50.49 
 
 
404 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  50.49 
 
 
415 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  51.47 
 
 
411 aa  203  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  50.49 
 
 
404 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  49.51 
 
 
410 aa  203  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  46.9 
 
 
408 aa  202  5e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  51.96 
 
 
412 aa  202  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  45.95 
 
 
276 aa  202  7e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  46.43 
 
 
404 aa  202  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  44.58 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  45.64 
 
 
279 aa  200  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  41.24 
 
 
284 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  45.06 
 
 
404 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  49.51 
 
 
404 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  49.12 
 
 
405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  47.95 
 
 
279 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  47.32 
 
 
398 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  49.12 
 
 
405 aa  195  9e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  47.49 
 
 
281 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  44.35 
 
 
310 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  47.03 
 
 
279 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  45.05 
 
 
307 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  44.35 
 
 
285 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  46.9 
 
 
275 aa  192  8e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  46.12 
 
 
568 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  49.76 
 
 
235 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  46.12 
 
 
454 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  47.27 
 
 
241 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  46.12 
 
 
281 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  46.58 
 
 
316 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  46.12 
 
 
281 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  46.12 
 
 
281 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  46.12 
 
 
281 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  49.3 
 
 
264 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  46.12 
 
 
281 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>