More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0152 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  100 
 
 		 361 aa  722    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  81.99 
 
 		 361 aa  565  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  83.1 
 
 		 361 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  67.87 
 
 		 361 aa  479  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2294  hypothetical protein  53.2 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  44.78 
 
 		 365 aa  298  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  40.46 
 
 		 391 aa  286  5e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  37.54 
 
 		 415 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  37.72 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  32.26 
 
 		 363 aa  182  9.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1868  hypothetical protein  34.14 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0467497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  31.69 
 
 		 358 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  30.87 
 
 		 362 aa  178  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  33.43 
 
 		 352 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  32.94 
 
 		 352 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  29.6 
 
 		 346 aa  172  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  31.5 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  31.63 
 
 		 363 aa  170  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  31.69 
 
 		 353 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  33.82 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  29.25 
 
 		 359 aa  169  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  33.53 
 
 		 406 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1707  protein of unknown function UPF0118  47.89 
 
 		 504 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  29.55 
 
 		 365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  31.88 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  31.56 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  30.21 
 
 		 358 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  30.9 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  31.59 
 
 		 398 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  32.17 
 
 		 355 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  31.59 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  31.9 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  31.59 
 
 		 350 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  28.12 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  31.88 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  30.97 
 
 		 354 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  31.7 
 
 		 371 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  30.03 
 
 		 353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  32.14 
 
 		 398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  29.5 
 
 		 379 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  30.89 
 
 		 352 aa  155  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  30.84 
 
 		 354 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  31.7 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  30.21 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  29.53 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  31.2 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  31.49 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  29.74 
 
 		 354 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  31.58 
 
 		 373 aa  152  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  28.14 
 
 		 354 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  29.41 
 
 		 349 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  28.15 
 
 		 356 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  30.46 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  30.28 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  30.28 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  30.28 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  30.28 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  27.75 
 
 		 362 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  30.28 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  30.28 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  30.28 
 
 		 374 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  28.61 
 
 		 354 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  29.55 
 
 		 394 aa  149  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  31.36 
 
 		 372 aa  149  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  32.73 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  30.47 
 
 		 381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  30.47 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  31.49 
 
 		 353 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2181  protein of unknown function UPF0118  30.7 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00612132  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  29.97 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  31.83 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  27.22 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  28.36 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  29.94 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  27.3 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  29.18 
 
 		 350 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2369  hypothetical protein  31.73 
 
 		 357 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00120754  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  31.14 
 
 		 361 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  28.57 
 
 		 352 aa  138  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0228  hypothetical protein  31.36 
 
 		 356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  26.11 
 
 		 353 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  27.16 
 
 		 362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  27.93 
 
 		 370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  29.17 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  27.95 
 
 		 392 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1677  hypothetical protein  29.41 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.696772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  34.65 
 
 		 361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  26.85 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  27.81 
 
 		 355 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  28.26 
 
 		 352 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2403  putative inner membrane protein  26.76 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0340493 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01657  predicted inner membrane protein  26.76 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  26.76 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1943  putative inner membrane protein  26.76 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987664 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1769  putative inner membrane protein  26.76 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1904  putative inner membrane protein  26.76 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1889  putative inner membrane protein  26.76 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  27.44 
 
 		 370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1508  putative inner membrane protein  26.76 
 
 		 370 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>