More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0599 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0599  tRNA-Lys  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0029  tRNA-Lys  92.19 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.395178  hitchhiker  0.000010783 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0073  tRNA-Lys  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0022  tRNA-Lys  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1954  tRNA-Lys  92.19 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156048  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0047  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0882  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000531124  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0027  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000236545  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0009  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.538917  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0009  tRNA-Lys  97.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161944  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.205376  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0054  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0028  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501499  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0046  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4583  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0571835  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0028  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.458439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0038  tRNA-Lys  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0027  tRNA-Lys  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0034  tRNA-Lys  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.285979  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0823  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0034  tRNA-Lys  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0719  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0005  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0037  tRNA-Lys  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205438  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14030  tRNA-Lys  89.83 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.36075e-34  hitchhiker  0.0017768 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0035  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.941173 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0052  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.040302  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0023  tRNA-Lys  97.37 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0043  tRNA-Lys  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102089  hitchhiker  0.00032415 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0023  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169137  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0047  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112802  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0048  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002395  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0025  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00236112  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2046  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000370287  hitchhiker  0.00336958 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt04  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0062  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0026  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21552  normal  0.0153028 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0052  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0045  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315592  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0029  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.781659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0071  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4589  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4239  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00412423  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0132  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0291  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0047  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0057  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000681091  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t26  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0026  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000013123  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0029  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0044    90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0031  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0016  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.519622  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0033  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.972639 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0031  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0046  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0453  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000219585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0022  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00514969  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0025  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445908  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1295  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0028  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.903037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0029  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0027  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224743  normal  0.75485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0021  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.503528  normal  0.129544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0079  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0013  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000652832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0031  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282035  normal  0.10093 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t11  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000006616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t36  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.036377  hitchhiker  0.00260797 
 
 
-
 
NC_002950  PGt44  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.305367 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0037  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0220661  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0035  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.073157  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t61  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0046  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt03  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt03  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA77  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0034  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0076  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0515739  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R85  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000392711  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60060  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.678993  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60180  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0044  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1988  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.977755  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5180  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.851962  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0030  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00181999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0018  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000023441  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0074  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0026  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0004  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0578  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0075  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.173249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0019  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23490  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00227157  hitchhiker  0.00614087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60180  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000682049  hitchhiker  0.0000000115444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0028  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.505293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0077  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.435861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0020  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>