288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_60180 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_60180  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t11  tRNA-Asn  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000006616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t36  tRNA-Asn  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.036377  hitchhiker  0.00260797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60180  tRNA-Asn  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000682049  hitchhiker  0.0000000115444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t11  tRNA-Asn  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.75816  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t39  tRNA-Asn  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.522109  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23490  tRNA-Asn  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00227157  hitchhiker  0.00614087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA46  tRNA-Asn  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00683435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA9  tRNA-Asn  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000000314512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0026  tRNA-Asn  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0021  tRNA-Asn  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.503528  normal  0.129544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5180  tRNA-Asn  97.26 
 
 		 78 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.851962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0004  tRNA-Asn  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0027  tRNA-Asn  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224743  normal  0.75485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0076  tRNA-Asn  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0515739  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0046  tRNA-Asn  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0028  tRNA-Asn  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.505293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0075  tRNA-Asn  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.173249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1988  tRNA-Asn  97.26 
 
 		 78 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.977755  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60060  tRNA-Asn  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.678993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R31  tRNA-Asn  96.97 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R85  tRNA-Asn  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000392711  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0086  tRNA-Asn  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000469656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0090  tRNA-Asn  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0039  tRNA-Asn  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000227587  normal  0.0269838 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0014  tRNA-Asn  91.53 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0049  tRNA-Asn  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000433504  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0050  tRNA-Asn  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000354715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0051  tRNA-Asn  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000442391  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0011  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00131891  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0024  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0032  tRNA-Asn  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172004  normal  0.954091 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0040  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0275291  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0054  tRNA-Asn  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0043  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102089  hitchhiker  0.00032415 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0040  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471786  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04000  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000234259  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0031  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.0000000000000420525  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2504  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000220613  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2816  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000213443  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000000733307  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000000219995  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0034  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000129233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0052  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000077031  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2876  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00000608308  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0036  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0058  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0204591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0039  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000683779  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0067  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0034  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000816877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0031  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0044  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.975167 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2933  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000103893  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2934  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000107091  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1828  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2815  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000000687096  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0041  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0042  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0039  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340367  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0033  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224831  normal  0.39291 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1546  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0015  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0000090416  normal  0.096467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0040  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000158111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1694  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655651  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1695  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000039183  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0629  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2877  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000083016  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0031  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1827  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383141  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0058  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161243  normal  0.35432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0059  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000863176  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0049  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0012  tRNA-Asn  97.56 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2777  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132175  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0041  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.0000000000000766368  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2778  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136224  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0017  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000497879  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0018  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000000318687  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0053  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146858  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0039  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.480095  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0040  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.345644  normal  0.239692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0033  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561489  normal  0.861574 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0034  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000927259  normal  0.865314 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0031  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0033  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0032  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.0000000000000399959  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0033  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000348439  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0028  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.546995  normal  0.0230083 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0034  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225096  normal  0.395781 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0012  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00139972  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0041  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000136051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2505  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000358439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0068  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0027  tRNA-Asn  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000466235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0041  tRNA-Asn  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000273116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0028  tRNA-Asn  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0043  tRNA-Asn  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00393457  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0599  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0010  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.026586  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0073  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>