More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_R0023 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_R0023  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0042  tRNA-Lys  98.68 
 
 		 75 bp  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000336952  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0043  tRNA-Lys  96.05 
 
 		 75 bp  119  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122965  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0039  tRNA-Lys  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t36  tRNA-Lys  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0013  tRNA-Lys  93.42 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.882004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0030  tRNA-Lys  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0471674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0035  tRNA-Lys  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.941173 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0034  tRNA-Lys  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0695  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0029  tRNA-Lys  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.379837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0030  tRNA-Lys  92.45 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.455261  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.489322  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_722  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0023  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.299591  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0037  tRNA-Lys  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0025  tRNA-Lys  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0599  tRNA-Lys  97.37 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0025  tRNA-Lys  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416946  unclonable  9.48259e-19 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0037  tRNA-Lys  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000296875  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0019  tRNA-Lys  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475559  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0078  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0983786 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0025  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.949692  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0026  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0030  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0044  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0696319 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0060  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00479449  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0061  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00229063  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0077  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0016  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0039  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.163516  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0033  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0047  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000113586  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0059  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0010  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000231874  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0081  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000716294  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000584403  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0096  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5678  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000591942  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5818  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000508092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5702  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00210319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4988  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5717  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5731  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447208  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0019  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021023  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0108  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00964752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5713  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000838851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0227  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166054  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0015534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000512626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0793  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44632e-33 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0138  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0085  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000677619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0019  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0246771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0135529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00616299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-6  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000599237  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0868  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0607  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000101667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5033  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556895  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.181325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000285821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000616859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0213  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000777909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5740  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4770  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000025693  hitchhiker  6.21743e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4563  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000215679  normal  0.0839515 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5002  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0532  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7224099999999997e-31 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000298609  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0435847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0124  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00762261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0142  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000202791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0128  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0112  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00195399  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5019  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00213455  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0061  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0045  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0045  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0010  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000409146  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5634  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5804  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00774483  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0061  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.269417  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0101  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0033  tRNA-Arg  86.36 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000397698  normal  0.298215 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0034  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0206765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0062  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.209249  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0042  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00104158  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0001  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0039  tRNA-Gln  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0047  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0026  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000756326  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0023  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.75812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>