More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0711 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  100 
 
 
157 aa  322  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 
156 aa  226  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  66.88 
 
 
156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  64.33 
 
 
156 aa  217  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3029  30S ribosomal protein S7  65.81 
 
 
157 aa  216  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00356201  hitchhiker  0.0000198077 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  65.19 
 
 
157 aa  216  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  216  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  215  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4030  30S ribosomal protein S7  66.45 
 
 
157 aa  215  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00016253  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1189  30S ribosomal protein S7  65.81 
 
 
157 aa  214  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109999  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  61.15 
 
 
156 aa  213  9e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  212  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  212  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  212  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  63.69 
 
 
156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_414  ribosomal protein S7  60.51 
 
 
156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000054715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  63.06 
 
 
156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  63.06 
 
 
156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  63.06 
 
 
156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  63.06 
 
 
156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  63.06 
 
 
156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  63.06 
 
 
156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  63.06 
 
 
156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  63.06 
 
 
156 aa  210  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0448  30S ribosomal protein S7  59.87 
 
 
156 aa  210  7e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307427  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0471  30S ribosomal protein S7  59.87 
 
 
156 aa  209  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000140142  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  64.33 
 
 
156 aa  209  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  61.15 
 
 
156 aa  209  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  61.78 
 
 
156 aa  209  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  61.78 
 
 
156 aa  209  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  63.06 
 
 
156 aa  209  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  61.15 
 
 
156 aa  209  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  62.42 
 
 
156 aa  208  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  62.42 
 
 
156 aa  209  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  62.42 
 
 
156 aa  209  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  62.42 
 
 
156 aa  209  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  62.42 
 
 
156 aa  209  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  64.38 
 
 
155 aa  207  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  64.38 
 
 
155 aa  207  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  62.42 
 
 
156 aa  207  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  60.51 
 
 
156 aa  207  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  62.42 
 
 
156 aa  207  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  58.6 
 
 
156 aa  206  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  61.15 
 
 
156 aa  206  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  57.96 
 
 
156 aa  205  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  60.51 
 
 
156 aa  205  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  60.51 
 
 
156 aa  204  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  59.87 
 
 
156 aa  204  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  60.51 
 
 
156 aa  204  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  59.87 
 
 
156 aa  204  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  60.51 
 
 
156 aa  204  5e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0221  30S ribosomal protein S7  61.15 
 
 
156 aa  204  6e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000044788  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  60.51 
 
 
156 aa  202  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  60.51 
 
 
156 aa  202  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  59.24 
 
 
156 aa  202  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  59.87 
 
 
156 aa  202  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  62.84 
 
 
156 aa  202  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  60.51 
 
 
156 aa  201  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  59.74 
 
 
155 aa  201  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0051  30S ribosomal protein S7  61.15 
 
 
156 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  64.19 
 
 
156 aa  201  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  59.87 
 
 
156 aa  201  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  59.87 
 
 
156 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  60.51 
 
 
156 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  59.24 
 
 
156 aa  201  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  59.24 
 
 
156 aa  201  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  59.24 
 
 
156 aa  201  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
155 aa  201  4e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0705  30S ribosomal protein S7  62.42 
 
 
156 aa  200  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2328  30S ribosomal protein S7  59.87 
 
 
156 aa  199  9e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000157389  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06200  30S ribosomal protein S7  61.78 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3276  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
157 aa  198  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000398939  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  58.6 
 
 
156 aa  197  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  57.96 
 
 
156 aa  198  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 
156 aa  197  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  57.32 
 
 
156 aa  197  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 
155 aa  197  5e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0323  30S ribosomal protein S7  61.15 
 
 
156 aa  197  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  57.96 
 
 
156 aa  197  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2861  30S ribosomal protein S7  59.24 
 
 
156 aa  197  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0179023  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  57.96 
 
 
156 aa  197  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0493  30S ribosomal protein S7  61.15 
 
 
156 aa  197  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00259026  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0622  30S ribosomal protein S7  59.24 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000278965  decreased coverage  1.81754e-21 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  57.96 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0450  30S ribosomal protein S7  60.51 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0295757  unclonable  0.000000315052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0480  30S ribosomal protein S7  60.51 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037317  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3913  30S ribosomal protein S7  60.51 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240756  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1602  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.630942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2732  30S ribosomal protein S7  56.69 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0483  30S ribosomal protein S7  60.51 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139239  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  57.96 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4753  30S ribosomal protein S7  60.51 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00430296  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  57.32 
 
 
156 aa  194  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0886  30S ribosomal protein S7  56.05 
 
 
156 aa  194  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0474  30S ribosomal protein S7  56.69 
 
 
156 aa  194  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 
156 aa  194  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  59.24 
 
 
156 aa  194  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2193  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.486436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>