More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0734 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  100 
 
 
344 aa  676  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  5.99785e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  95.64 
 
 
344 aa  633  1e-180  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  53.85 
 
 
348 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  53.85 
 
 
348 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  54.14 
 
 
348 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  47.08 
 
 
354 aa  347  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  52.05 
 
 
349 aa  347  2e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  48.84 
 
 
357 aa  335  7e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  49.42 
 
 
357 aa  328  9e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  47.76 
 
 
340 aa  323  3e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  46.65 
 
 
358 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  45.22 
 
 
356 aa  303  4e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  44.48 
 
 
355 aa  300  3e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  46.67 
 
 
363 aa  296  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  43.73 
 
 
370 aa  291  1e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  45.08 
 
 
336 aa  284  2e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  42.48 
 
 
357 aa  283  4e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  43.67 
 
 
359 aa  283  4e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  42.73 
 
 
356 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  44.71 
 
 
350 aa  270  3e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  44.77 
 
 
357 aa  269  5e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1175  iron ABC transporter permease  44.44 
 
 
359 aa  268  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  44.9 
 
 
374 aa  260  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  41.38 
 
 
355 aa  256  5e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.06 
 
 
346 aa  254  1e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  42.65 
 
 
350 aa  254  1e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  40.69 
 
 
362 aa  254  2e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2148  transport system permease protein  44.48 
 
 
356 aa  253  2e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.176717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  41.23 
 
 
360 aa  250  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  38.86 
 
 
373 aa  250  3e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  42.9 
 
 
356 aa  244  2e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  39.54 
 
 
367 aa  244  2e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  41.79 
 
 
369 aa  243  3e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  40.52 
 
 
383 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  44.18 
 
 
301 aa  235  7e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  38.21 
 
 
331 aa  232  8e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0815  transport system permease protein  44.48 
 
 
346 aa  231  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  37.05 
 
 
375 aa  224  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  39.19 
 
 
361 aa  223  5e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  40.06 
 
 
360 aa  220  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  43.99 
 
 
362 aa  220  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  40.25 
 
 
363 aa  219  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  37.58 
 
 
356 aa  219  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  35.63 
 
 
356 aa  214  1e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  37.28 
 
 
347 aa  215  1e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  36.42 
 
 
343 aa  213  4e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  37.71 
 
 
361 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  39.4 
 
 
345 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0990  transport system permease protein  39.3 
 
 
378 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  38.44 
 
 
355 aa  208  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  38.44 
 
 
345 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  39.18 
 
 
345 aa  205  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  6.56529e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  37.65 
 
 
342 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  33.64 
 
 
330 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  39.94 
 
 
325 aa  203  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  36.73 
 
 
347 aa  203  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  33.94 
 
 
330 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  35.71 
 
 
370 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1284  transport system permease protein  42.01 
 
 
338 aa  202  7e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.601831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  36.73 
 
 
337 aa  202  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  37.28 
 
 
354 aa  201  2e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.96 
 
 
337 aa  199  4e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.07964e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  35.28 
 
 
356 aa  198  1e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  39.31 
 
 
358 aa  198  1e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 
342 aa  197  2e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  38.44 
 
 
356 aa  196  5e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 
342 aa  196  5e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  35.8 
 
 
342 aa  196  5e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  36.79 
 
 
342 aa  196  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  39.19 
 
 
354 aa  196  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  37.76 
 
 
366 aa  196  7e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  35.5 
 
 
345 aa  195  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  35.19 
 
 
342 aa  195  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  35.19 
 
 
342 aa  195  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  35.5 
 
 
345 aa  195  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  36.96 
 
 
347 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  36.23 
 
 
360 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  39.1 
 
 
315 aa  195  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  1.18421e-05  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  35.71 
 
 
330 aa  195  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  36.02 
 
 
334 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  36.02 
 
 
334 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  36.02 
 
 
334 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  34.69 
 
 
356 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  35.67 
 
 
331 aa  192  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  36.15 
 
 
365 aa  192  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  31.98 
 
 
338 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  31.98 
 
 
338 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  37.66 
 
 
357 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  36.81 
 
 
352 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  38.46 
 
 
338 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  39.52 
 
 
338 aa  190  3e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  32.75 
 
 
359 aa  189  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  36.01 
 
 
371 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  35.87 
 
 
367 aa  190  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  38.36 
 
 
350 aa  190  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  34.69 
 
 
363 aa  189  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  36.73 
 
 
357 aa  190  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2697  transport system permease protein  38.85 
 
 
352 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0039  transport system permease protein  35.1 
 
 
323 aa  189  7e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00831442  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2719  transport system permease protein  36.36 
 
 
352 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  7.28456e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>