116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2822 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 314 aa  647    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.26 
 
 		 314 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.11 
 
 		 311 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.78 
 
 		 311 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0837  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.46 
 
 		 311 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.82 
 
 		 307 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.7 
 
 		 312 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3195  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.9 
 
 		 311 aa  363  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.67739  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1297  saccharopine dehydrogenase related protein  54.79 
 
 		 305 aa  359  4e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.56 
 
 		 308 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.49 
 
 		 304 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.84 
 
 		 319 aa  195  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.22 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.92 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.39 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.01 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 		 318 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 		 316 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.89 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.93 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34 
 
 		 329 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.67 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29 
 
 		 304 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.66 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.765071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  29.08 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 		 340 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.73 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 		 327 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.61 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  30.6 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  30.6 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  30.6 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  30.6 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.85 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.85 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.85 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.22 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  26.22 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.22 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.22 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.22 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.22 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 		 321 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 		 321 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  31.68 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 		 320 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.22 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  28.4 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.49 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370756  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.41 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 		 318 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 		 352 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0715  epimerase/dehydratase family protein, putative  25.75 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  25.19 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2011  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.04 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.45 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.701865  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  24.54 
 
 		 680 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 		 320 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>