More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1659 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  100 
 
 		 398 aa  750    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  47.3 
 
 		 412 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  47.8 
 
 		 424 aa  289  6e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  43.52 
 
 		 416 aa  272  6e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3301  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  48.56 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.31 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.12 
 
 		 419 aa  266  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.6 
 
 		 416 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.86 
 
 		 419 aa  265  8e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  42.86 
 
 		 416 aa  265  8e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  42.86 
 
 		 416 aa  265  8e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.6 
 
 		 416 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.6 
 
 		 416 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  43.12 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_1599  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.91 
 
 		 384 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  47.21 
 
 		 411 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.19 
 
 		 417 aa  254  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.8 
 
 		 425 aa  253  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.8 
 
 		 415 aa  250  4e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.67 
 
 		 461 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.09 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_0874  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.38 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_0184  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.26 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_22050  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.38 
 
 		 437 aa  242  7e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.972538 
 
 
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NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.82 
 
 		 425 aa  242  7.999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.5 
 
 		 440 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.42 
 
 		 399 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  41.53 
 
 		 387 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
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NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  41.15 
 
 		 387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624404 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.76 
 
 		 399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.9 
 
 		 437 aa  239  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.47 
 
 		 398 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  39.54 
 
 		 398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1734  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.35 
 
 		 435 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.16 
 
 		 403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  36 
 
 		 392 aa  233  6e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_3262  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.09 
 
 		 414 aa  232  7.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.35835  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_0437  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.88 
 
 		 398 aa  232  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.34 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.61 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.47 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  41.21 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.96 
 
 		 396 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  40.62 
 
 		 407 aa  230  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.28 
 
 		 414 aa  229  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
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NC_009338  Mflv_2220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.81 
 
 		 430 aa  229  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009802  CCC13826_0494  molybdopterin biosynthesis protein  34.19 
 
 		 386 aa  228  2e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_1251  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.63 
 
 		 410 aa  227  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0659251  normal  0.330934 
 
 
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NC_012669  Bcav_0234  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  46.94 
 
 		 448 aa  226  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4345  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.39 
 
 		 406 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  39.02 
 
 		 392 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  39.02 
 
 		 392 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.34 
 
 		 412 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  41.19 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.19 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.16 
 
 		 403 aa  223  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_3830  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.61 
 
 		 413 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423466  normal  1 
 
 
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NC_012880  Dd703_2514  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.51 
 
 		 397 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.69 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.34 
 
 		 408 aa  223  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.95 
 
 		 393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_014210  Ndas_2399  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.76 
 
 		 457 aa  222  7e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.35739 
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.18 
 
 		 394 aa  222  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.77 
 
 		 406 aa  222  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_3036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.25 
 
 		 414 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
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NC_013235  Namu_4889  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.21 
 
 		 419 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.41 
 
 		 414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.92 
 
 		 394 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.49 
 
 		 400 aa  219  8.999999999999998e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.68 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1190  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.19 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.63 
 
 		 424 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.66 
 
 		 396 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
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NC_009664  Krad_4430  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.62 
 
 		 454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0528088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.86 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.48 
 
 		 401 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1377  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.48 
 
 		 406 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.54 
 
 		 435 aa  212  9e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000185611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.96 
 
 		 396 aa  210  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.94 
 
 		 436 aa  210  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1358  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.07 
 
 		 403 aa  209  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.43 
 
 		 411 aa  209  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.55 
 
 		 412 aa  209  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.7 
 
 		 407 aa  209  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.51 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_004310  BR1401  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.07 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.33 
 
 		 498 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
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NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.33 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_1341  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.53 
 
 		 407 aa  207  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.490339  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_1367  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.1 
 
 		 425 aa  206  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_28940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.64 
 
 		 408 aa  206  7e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592118  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_3985  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.19 
 
 		 439 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.675837  normal  0.216799 
 
 
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NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.31 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.71 
 
 		 413 aa  203  4e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_3971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.93 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.740446  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_4045  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.93 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.77 
 
 		 435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  38.83 
 
 		 392 aa  200  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.69 
 
 		 404 aa  201  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
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