More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4345 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4345  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  100 
 
 		 406 aa  766    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  47.99 
 
 		 412 aa  316  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  52.56 
 
 		 424 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  47.06 
 
 		 416 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  47.06 
 
 		 416 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  46.68 
 
 		 416 aa  292  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.74 
 
 		 398 aa  292  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.94 
 
 		 419 aa  292  8e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.68 
 
 		 416 aa  292  9e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.68 
 
 		 416 aa  292  9e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  46.8 
 
 		 416 aa  292  9e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.68 
 
 		 419 aa  291  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.68 
 
 		 416 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.62 
 
 		 417 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1599  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.76 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.64 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.85 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.17 
 
 		 414 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.25 
 
 		 415 aa  264  3e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.3 
 
 		 393 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_013205  Aaci_0874  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  46.37 
 
 		 417 aa  261  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.98 
 
 		 411 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.51 
 
 		 425 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_0184  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.45 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.51 
 
 		 401 aa  259  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.33 
 
 		 394 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  42.35 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  45.65 
 
 		 411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.35 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  41.19 
 
 		 398 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.5 
 
 		 424 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.48 
 
 		 407 aa  253  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.46 
 
 		 398 aa  252  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3301  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  47.38 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.09 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.86 
 
 		 408 aa  250  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  40.22 
 
 		 426 aa  250  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  42.12 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.2 
 
 		 412 aa  247  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_2399  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.53 
 
 		 457 aa  246  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.35739 
 
 
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NC_013235  Namu_1251  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  47.04 
 
 		 410 aa  246  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0659251  normal  0.330934 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  41.78 
 
 		 392 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  41.51 
 
 		 392 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.31 
 
 		 399 aa  246  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_3830  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.4 
 
 		 413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423466  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.86 
 
 		 440 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1190  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.86 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  40.05 
 
 		 426 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_009953  Sare_3262  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.54 
 
 		 414 aa  239  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.35835  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.35 
 
 		 437 aa  239  8e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
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NC_009664  Krad_1389  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.99 
 
 		 387 aa  232  7.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0010399  normal  0.0253639 
 
 
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NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  46.48 
 
 		 425 aa  229  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  38.78 
 
 		 387 aa  229  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
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NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  38.27 
 
 		 387 aa  229  8e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624404 
 
 
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NC_012880  Dd703_2514  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.43 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  37.56 
 
 		 420 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 		 403 aa  227  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1734  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.23 
 
 		 435 aa  227  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.59 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_1377  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.66 
 
 		 406 aa  226  7e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
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NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.8 
 
 		 406 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.4 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.13 
 
 		 461 aa  224  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22050  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.16 
 
 		 437 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.972538 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.82 
 
 		 434 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.6 
 
 		 405 aa  222  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.71 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.82 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  35.97 
 
 		 392 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.25 
 
 		 405 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.43 
 
 		 404 aa  219  7e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  39.19 
 
 		 404 aa  219  7e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.54 
 
 		 399 aa  219  8.999999999999998e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.66 
 
 		 409 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
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NC_009802  CCC13826_0494  molybdopterin biosynthesis protein  36.32 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.63 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.09 
 
 		 400 aa  217  2e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.58 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.5 
 
 		 414 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.25 
 
 		 458 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.25 
 
 		 405 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.25 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.64 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41 
 
 		 414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
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NC_008541  Arth_1341  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.11 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.490339  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.24 
 
 		 406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
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NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.93 
 
 		 498 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
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NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.19 
 
 		 438 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.85 
 
 		 409 aa  213  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  33.25 
 
 		 413 aa  212  7.999999999999999e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_1367  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.5 
 
 		 425 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.51 
 
 		 399 aa  212  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.5 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.82 
 
 		 403 aa  211  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.18 
 
 		 401 aa  210  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.2 
 
 		 408 aa  209  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
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NC_002976  SERP1947  tcaB protein  35.22 
 
 		 403 aa  209  9e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.04 
 
 		 411 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.31 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.31 
 
 		 412 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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