More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0248 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  58.63 
 
 
250 aa  310  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  52.78 
 
 
253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  50.2 
 
 
257 aa  224  7e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  50.2 
 
 
257 aa  223  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 
294 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  37.13 
 
 
245 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  34.66 
 
 
279 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 
291 aa  142  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  34.52 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 
289 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 
289 aa  138  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  32.92 
 
 
263 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  30.08 
 
 
286 aa  125  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
328 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 
306 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  30.52 
 
 
300 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  31.82 
 
 
267 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  31.82 
 
 
267 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  31.82 
 
 
267 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  31.82 
 
 
272 aa  111  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  31.82 
 
 
267 aa  111  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  32.16 
 
 
277 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  31.76 
 
 
277 aa  110  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 
267 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  30.58 
 
 
267 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  30.99 
 
 
267 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  30.99 
 
 
267 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  31.4 
 
 
277 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
275 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  30.54 
 
 
267 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
281 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  27.06 
 
 
278 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  31.37 
 
 
277 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 
302 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5281  alpha/beta hydrolase fold protein  35.32 
 
 
288 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
302 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
302 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
302 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  28.24 
 
 
306 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 
286 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
279 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  27.82 
 
 
279 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 
330 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  29 
 
 
301 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
320 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
290 aa  97.8  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  29.53 
 
 
279 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  27.68 
 
 
288 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  28.91 
 
 
318 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
289 aa  96.3  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  28.63 
 
 
280 aa  95.5  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  28.91 
 
 
303 aa  95.1  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  28.91 
 
 
303 aa  95.1  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  28.91 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
320 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  28.91 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  28.91 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  28.91 
 
 
303 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  26.36 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  25.19 
 
 
279 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  25.19 
 
 
279 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  28.52 
 
 
303 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  25.19 
 
 
279 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  32.79 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  30.68 
 
 
274 aa  90.5  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  27.65 
 
 
288 aa  90.1  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2989  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960197  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  24.44 
 
 
290 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  27.17 
 
 
277 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 
315 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.09 
 
 
291 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 
270 aa  85.1  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 
559 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1353  alpha/beta hydrolase fold  23.6 
 
 
589 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830773  normal  0.156007 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0893  alpha/beta hydrolase fold  23.6 
 
 
589 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1375  alpha/beta hydrolase fold  23.6 
 
 
589 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0199502  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4520  Alpha/beta hydrolase  23.6 
 
 
589 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1591  hypothetical protein  25.51 
 
 
585 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2883  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 
594 aa  79.3  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752135  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1278  alpha/beta hydrolase fold  23.6 
 
 
599 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256171 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1762  hypothetical protein  25.1 
 
 
585 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000563252 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1253  alpha/beta hydrolase fold  23.6 
 
 
599 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5537  hypothetical protein  26.34 
 
 
585 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2013  hypothetical protein  25.1 
 
 
585 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.329786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  27.8 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2146  alpha/beta fold family hydrolase  26.48 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2235  conserved hypothetical protein  25.93 
 
 
585 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1493  hypothetical protein  25.93 
 
 
585 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01377  hypothetical protein  25.93 
 
 
585 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.748745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2248  hypothetical protein  25.93 
 
 
585 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.555359  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>