More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0935 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
468 aa  925    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  64.12 
 
 
472 aa  496  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  60.26 
 
 
477 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1811  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  59.1 
 
 
477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.497016  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0510  glutamyl-tRNA synthetase  59.79 
 
 
466 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  53.79 
 
 
465 aa  431  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  53.79 
 
 
465 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  61.72 
 
 
475 aa  425  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 
508 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 
482 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 
488 aa  317  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
490 aa  316  6e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
485 aa  307  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  42.35 
 
 
546 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
482 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
494 aa  296  5e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 
488 aa  293  5e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
464 aa  291  1e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
481 aa  291  2e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
504 aa  288  2e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
485 aa  286  8e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
492 aa  284  3.0000000000000004e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
498 aa  283  5.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
469 aa  281  2e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 
485 aa  281  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
477 aa  280  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
479 aa  280  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  38.39 
 
 
495 aa  280  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
469 aa  280  4e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
535 aa  280  4e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
485 aa  279  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
473 aa  277  2e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 
491 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
491 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
485 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
485 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
485 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
485 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
485 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
485 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
495 aa  272  7e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
480 aa  271  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 
485 aa  272  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  44.92 
 
 
518 aa  272  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
467 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 
488 aa  270  2.9999999999999997e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 
470 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
490 aa  269  7e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 
491 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 
467 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 
467 aa  268  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 
471 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 
484 aa  267  4e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 
469 aa  266  4e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
492 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_52655  glutamyl-trna synthase  44.67 
 
 
588 aa  266  5.999999999999999e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233509  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
471 aa  266  7e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
470 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
496 aa  265  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
506 aa  264  3e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
469 aa  263  4e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
469 aa  263  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 
465 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
491 aa  263  4.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
466 aa  263  6e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 
466 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
469 aa  262  1e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
473 aa  261  1e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 
468 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
501 aa  260  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
494 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
486 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
469 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
469 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
472 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
469 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
488 aa  259  6e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 
468 aa  259  7e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
471 aa  259  9e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
484 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
471 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
471 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
484 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
490 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
466 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  49.53 
 
 
323 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
466 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 
491 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
471 aa  257  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
494 aa  257  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 
469 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
472 aa  257  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 
469 aa  257  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634908  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
469 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2802  glutamyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
469 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000260001  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
466 aa  256  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
469 aa  256  6e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
472 aa  256  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>