More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3110 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  100 
 
 		 295 aa  589  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  65.62 
 
 		 312 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  64.46 
 
 		 333 aa  354  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  63.6 
 
 		 323 aa  353  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  67.55 
 
 		 309 aa  352  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  66.54 
 
 		 314 aa  348  6e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  63.84 
 
 		 329 aa  341  8e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  65.07 
 
 		 328 aa  340  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  62.37 
 
 		 318 aa  337  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  58.97 
 
 		 321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  63.81 
 
 		 335 aa  335  5e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  63.74 
 
 		 392 aa  325  6e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  61.62 
 
 		 529 aa  325  6e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  60.34 
 
 		 379 aa  324  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  59.79 
 
 		 472 aa  320  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  60.85 
 
 		 344 aa  319  3e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  59.79 
 
 		 334 aa  319  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  61.11 
 
 		 331 aa  319  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  61.37 
 
 		 324 aa  318  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  62.96 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  62.96 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  62.96 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  60.35 
 
 		 383 aa  315  8e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  58.11 
 
 		 331 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  59.07 
 
 		 367 aa  312  4.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4506  parB-like partition protein  60.14 
 
 		 410 aa  312  4.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  61.03 
 
 		 341 aa  311  7.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  59.23 
 
 		 391 aa  310  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  59.78 
 
 		 377 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  54.64 
 
 		 358 aa  289  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5089  parB-like partition protein  57.41 
 
 		 347 aa  288  7e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  58.27 
 
 		 268 aa  286  2e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  49.03 
 
 		 424 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  55.12 
 
 		 398 aa  269  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0053  ParB-like protein  50.33 
 
 		 450 aa  269  4e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3930  parB-like partition protein  57.14 
 
 		 438 aa  267  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000021356 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4165  chromosome segregation DNA-binding protein  55.84 
 
 		 394 aa  255  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308582  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31910  ParB-like partition protein  54.61 
 
 		 624 aa  251  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  49.28 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  44.74 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  44.74 
 
 		 283 aa  219  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  45.15 
 
 		 283 aa  218  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  44.74 
 
 		 283 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  44.74 
 
 		 283 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  44.36 
 
 		 283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  44.74 
 
 		 283 aa  215  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  44.83 
 
 		 256 aa  215  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  41.44 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  44.36 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  43.96 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  44.44 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  44.03 
 
 		 283 aa  208  8e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  41.57 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  43.77 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  43.35 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  42.65 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  42.26 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  41.7 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  42.25 
 
 		 295 aa  206  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  40.48 
 
 		 289 aa  205  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  42.37 
 
 		 289 aa  205  9e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  40.7 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  42.53 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  40.28 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  43.13 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  41.55 
 
 		 292 aa  203  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  40.44 
 
 		 289 aa  202  7e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  42.45 
 
 		 294 aa  202  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  41.31 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  38.1 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  41.67 
 
 		 297 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  40.31 
 
 		 286 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  40.31 
 
 		 286 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  49.75 
 
 		 287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  38.52 
 
 		 281 aa  198  7.999999999999999e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  39.69 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  47.95 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  47.95 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  39.18 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  43.24 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  41.16 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  42.86 
 
 		 307 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  40.46 
 
 		 303 aa  193  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  41.22 
 
 		 282 aa  193  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  42.42 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  39.69 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  40.15 
 
 		 302 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  41.63 
 
 		 279 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  41.67 
 
 		 282 aa  192  7e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  38.77 
 
 		 293 aa  192  7e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  39.42 
 
 		 285 aa  191  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  40.15 
 
 		 284 aa  191  9e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  43.28 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  36.74 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  39.85 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  36.74 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  41.15 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  39.71 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  43.3 
 
 		 293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  40.22 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>