More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1732 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  100 
 
 
321 aa  645  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  55.8 
 
 
326 aa  335  9e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  56.69 
 
 
343 aa  327  1e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2488  glycosyl transferase family 2  58.95 
 
 
335 aa  323  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  59.38 
 
 
330 aa  321  9e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  56.8 
 
 
334 aa  308  8e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3452  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  60.32 
 
 
318 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.0411609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  53.25 
 
 
342 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0167  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  54.95 
 
 
315 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.33874  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0337  glycosyl transferase family 2  58.31 
 
 
320 aa  285  1e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0338  glycosyl transferase family 2  53.09 
 
 
324 aa  273  4e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  54.41 
 
 
299 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2860  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  42.36 
 
 
325 aa  241  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  43.73 
 
 
359 aa  238  8e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1142  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  39.23 
 
 
325 aa  236  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  48.87 
 
 
312 aa  236  5e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  44.98 
 
 
316 aa  232  8e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2312  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  42.55 
 
 
335 aa  225  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  43 
 
 
319 aa  214  1e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  42.76 
 
 
324 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  43.32 
 
 
319 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5332  glycosyl transferase family 2  46.75 
 
 
329 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.94 
 
 
334 aa  198  8e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.94 
 
 
334 aa  198  8e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.94 
 
 
334 aa  198  8e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1165  glycosyl transferase family 2  45.51 
 
 
302 aa  197  2e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
510 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09131  hypothetical protein  29.44 
 
 
395 aa  85.9  1e-15  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.554848  hitchhiker  0.00082103 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0245  hypothetical protein  29.44 
 
 
395 aa  85.5  1e-15  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0654  hypothetical protein  29.77 
 
 
391 aa  80.5  3e-14  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2607  hypothetical protein  34.31 
 
 
430 aa  79.3  9e-14  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166847  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06741  hypothetical protein  34.48 
 
 
402 aa  78.6  1e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0870482  normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0837  hypothetical protein  29.9 
 
 
408 aa  77  4e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08961  hypothetical protein  29.9 
 
 
408 aa  77  4e-13  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.359171  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10451  hypothetical protein  29.41 
 
 
408 aa  75.1  2e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 
209 aa  74.3  3e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2244  hypothetical protein  33.33 
 
 
425 aa  74.3  3e-12  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08941  hypothetical protein  29.41 
 
 
408 aa  73.9  3e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  36.62 
 
 
522 aa  73.6  5e-12  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
228 aa  73.2  6e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  37.07 
 
 
222 aa  72  1e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 
236 aa  72  1e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4062  hypothetical protein  29.73 
 
 
356 aa  70.1  4e-11  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  40.4 
 
 
365 aa  70.1  4e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
206 aa  69.7  5e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3045  glycosyltransferase-like protein  36.65 
 
 
363 aa  70.1  5e-11  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1195  glycosyltransferase-like protein  30.67 
 
 
365 aa  68.6  1e-10  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.809596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  39.29 
 
 
693 aa  68.6  2e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1456  glycosyltransferase-like protein  34.81 
 
 
397 aa  67.4  3e-10  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.443232  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0737  hypothetical protein  29.59 
 
 
404 aa  67  4e-10  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2567  cell wall biogenesis glycosyltransferase  27.1 
 
 
407 aa  66.2  7e-10  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0206766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2581  cell wall biogenesis glycosyltransferase  27.1 
 
 
407 aa  66.2  7e-10  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000562395  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2574  cell wall biogenesis glycosyltransferase  27.1 
 
 
407 aa  66.2  7e-10  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00191842  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02160  cell wall biogenesis glycosyltransferase  29.94 
 
 
407 aa  66.2  7e-10  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409645  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
226 aa  65.9  8e-10  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2847  hypothetical protein  25.87 
 
 
406 aa  65.9  9e-10  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 
230 aa  65.9  9e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
213 aa  65.5  1e-09  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0507  hypothetical protein  26.67 
 
 
408 aa  63.9  3e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551714  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  39.47 
 
 
222 aa  63.9  3e-09  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2601  hypothetical protein  27.1 
 
 
408 aa  63.2  5e-09  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.625325  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6919  glycosyl transferase family 2  35.83 
 
 
241 aa  63.2  6e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  6.75814e-06  hitchhiker  0.000119796 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  30 
 
 
322 aa  62.8  8e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  6.47727e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1772  cell wall biogenesis glycosyltransferase  24.44 
 
 
409 aa  62.4  9e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  33.07 
 
 
410 aa  62  1e-08  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1890  hypothetical protein  25.38 
 
 
409 aa  61.6  2e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116319  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1821  hypothetical protein  28.04 
 
 
416 aa  61.6  2e-08  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117561  normal  0.653656 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 
257 aa  61.2  2e-08  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3189  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 
279 aa  60.5  4e-08  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.343721  normal  0.0208978 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
313 aa  60.1  5e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  2.21538e-06 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 
242 aa  59.7  6e-08  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1287  cell wall biogenesis glycosyltransferase  35.9 
 
 
373 aa  59.7  7e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
315 aa  59.3  8e-08  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 
258 aa  59.3  9e-08  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0260  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
273 aa  59.3  1e-07  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.306809  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2129  hypothetical protein  25.55 
 
 
408 aa  58.5  1e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
285 aa  59.3  1e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.28 
 
 
410 aa  58.5  1e-07  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
247 aa  58.2  2e-07  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2620  glycosyltransferase-like protein  30.51 
 
 
448 aa  58.5  2e-07  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0021  glycosyl transferase family 2  37.37 
 
 
330 aa  58.2  2e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  35.04 
 
 
285 aa  57.8  3e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0824  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
234 aa  57.4  3e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.216941  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2603  hypothetical protein  30.36 
 
 
406 aa  57.4  4e-07  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2163  cell wall biogenesis glycosyltransferase  27.54 
 
 
409 aa  57  5e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.407321  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
318 aa  56.6  5e-07  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  37.11 
 
 
291 aa  56.6  5e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
332 aa  56.6  5e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  36.89 
 
 
238 aa  57  5e-07  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.5 
 
 
528 aa  57  5e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  31.29 
 
 
237 aa  56.6  6e-07  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4380  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 
314 aa  56.2  7e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4442  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 
314 aa  56.2  7e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1452  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
299 aa  56.2  7e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591361 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
231 aa  56.2  7e-07  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3209  hypothetical protein  25.7 
 
 
406 aa  56.2  8e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  29.35 
 
 
309 aa  56.2  8e-07  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1867  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
507 aa  55.8  9e-07  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0742867  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 
349 aa  55.5  1e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05405  putative glycosyltransferase  30.65 
 
 
231 aa  55.1  1e-06  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.507881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>