More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1732 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  100 
 
 		 321 aa  645    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  55.8 
 
 		 326 aa  335  9e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  56.69 
 
 		 343 aa  327  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2488  glycosyl transferase family 2  58.95 
 
 		 335 aa  323  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  59.38 
 
 		 330 aa  321  9.000000000000001e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  56.8 
 
 		 334 aa  308  8e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3452  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  60.32 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.0411609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  53.25 
 
 		 342 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0167  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  54.95 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0337  glycosyl transferase family 2  58.31 
 
 		 320 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0338  glycosyl transferase family 2  53.09 
 
 		 324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  54.41 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2860  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  42.36 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  43.73 
 
 		 359 aa  238  8e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1142  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  39.23 
 
 		 325 aa  236  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  48.87 
 
 		 312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  44.98 
 
 		 316 aa  232  8.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2312  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  42.55 
 
 		 335 aa  225  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  43 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  42.76 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  43.32 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5332  glycosyl transferase family 2  46.75 
 
 		 329 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.94 
 
 		 334 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.94 
 
 		 334 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.94 
 
 		 334 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1165  glycosyl transferase family 2  45.51 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 		 510 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0245  hypothetical protein  29.44 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09131  hypothetical protein  29.44 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.554848  hitchhiker  0.00082103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0654  hypothetical protein  29.77 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2607  hypothetical protein  34.31 
 
 		 430 aa  79.3  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166847  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06741  hypothetical protein  34.48 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0870482  normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0837  hypothetical protein  29.9 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08961  hypothetical protein  29.9 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.359171  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10451  hypothetical protein  29.41 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2244  hypothetical protein  33.33 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08941  hypothetical protein  29.41 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  36.62 
 
 		 522 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  37.07 
 
 		 222 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 		 236 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4062  hypothetical protein  29.73 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  40.4 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3045  glycosyltransferase-like protein  36.65 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1195  glycosyltransferase-like protein  30.67 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.809596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  39.29 
 
 		 693 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1456  glycosyltransferase-like protein  34.81 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.443232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0737  hypothetical protein  29.59 
 
 		 404 aa  67  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02160  cell wall biogenesis glycosyltransferase  29.94 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2567  cell wall biogenesis glycosyltransferase  27.1 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0206766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2574  cell wall biogenesis glycosyltransferase  27.1 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00191842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2581  cell wall biogenesis glycosyltransferase  27.1 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000562395  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2847  hypothetical protein  25.87 
 
 		 406 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 		 213 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0507  hypothetical protein  26.67 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551714  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  39.47 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2601  hypothetical protein  27.1 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.625325  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6919  glycosyl transferase family 2  35.83 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000675814  hitchhiker  0.000119796 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  30 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1772  cell wall biogenesis glycosyltransferase  24.44 
 
 		 409 aa  62.4  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  33.07 
 
 		 410 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1821  hypothetical protein  28.04 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117561  normal  0.653656 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1890  hypothetical protein  25.38 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116319  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3189  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.343721  normal  0.0208978 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1287  cell wall biogenesis glycosyltransferase  35.9 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.28 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0260  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 		 273 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.306809  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2129  hypothetical protein  25.55 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 		 285 aa  59.3  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2620  glycosyltransferase-like protein  30.51 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0021  glycosyl transferase family 2  37.37 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  35.04 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0824  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.216941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2603  hypothetical protein  30.36 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  37.11 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.5 
 
 		 528 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2163  cell wall biogenesis glycosyltransferase  27.54 
 
 		 409 aa  57  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.407321  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  36.89 
 
 		 238 aa  57  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  31.29 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4380  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4442  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1452  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591361 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  29.35 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3209  hypothetical protein  25.7 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1867  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 		 507 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0742867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2052  hypothetical protein  29.73 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>