49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2236 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2236  hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  959    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555143  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2132  hypothetical protein  41.38 
 
 
699 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.565923  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2234  hypothetical protein  92.77 
 
 
85 aa  159  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2233  hypothetical protein  92.77 
 
 
85 aa  159  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2231  hypothetical protein  91.57 
 
 
85 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2235  hypothetical protein  89.16 
 
 
85 aa  153  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.712461  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2232  hypothetical protein  89.16 
 
 
85 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2230  hypothetical protein  73.68 
 
 
507 aa  114  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  29.18 
 
 
1238 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.02 
 
 
943 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  26.28 
 
 
496 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3909  hypothetical protein  24.52 
 
 
697 aa  87  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 
1285 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3208  hypothetical protein  25.48 
 
 
689 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.905159  normal  0.252675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3408  heat repeat-containing PBS lyase  25.77 
 
 
1203 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.539879 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 
1958 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 
1298 aa  76.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4219  heterocyst differentiation protein  22.67 
 
 
806 aa  73.6  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.638928 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 
1063 aa  73.2  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3525  heterocyst differentiation protein  21.7 
 
 
835 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.857828  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  30.26 
 
 
1914 aa  67.8  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0033  heterocyst differentiation protein HetF  20.89 
 
 
823 aa  67.8  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2281  hypothetical protein  28.3 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503347  normal  0.134184 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4363  hypothetical protein  22.4 
 
 
534 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 
1313 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
1714 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.96 
 
 
1279 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5145  hypothetical protein  23.59 
 
 
1689 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0775613  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3255  FHA domain containing protein  22.42 
 
 
569 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.21 
 
 
1195 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 
1101 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0305  FHA domain-containing protein  21.49 
 
 
525 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1155  hypothetical protein  23.34 
 
 
689 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2711  FHA domain-containing protein  23.55 
 
 
544 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
1596 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3126  hypothetical protein  28.48 
 
 
383 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000917483  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5578  hypothetical protein  24.81 
 
 
502 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1337  FHA domain-containing protein  21.49 
 
 
559 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3407  FHA domain containing protein  20.51 
 
 
562 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3350  GUN4-like  25.29 
 
 
979 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2709  FHA domain containing protein  20.51 
 
 
562 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  26.63 
 
 
1429 aa  50.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0047  hypothetical protein  26.15 
 
 
489 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  34.45 
 
 
534 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  25.13 
 
 
504 aa  47.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  25.56 
 
 
1611 aa  47  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  24.08 
 
 
2159 aa  47  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0200  hypothetical protein  23.36 
 
 
1268 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.01392  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
1450 aa  43.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>