61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0637 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0637  rhomboid-like protein  100 
 
 		 191 aa  370  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2687  Rhomboid family protein  50.53 
 
 		 195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0458  Rhomboid family protein  49.47 
 
 		 199 aa  188  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365759  normal  0.0342055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0445  Rhomboid family protein  49.47 
 
 		 199 aa  188  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0440  Rhomboid family protein  44.15 
 
 		 194 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0836383  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4537  Rhomboid family protein  38.71 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1835  hypothetical protein  48.88 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.210618 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2931  hypothetical protein  40.86 
 
 		 209 aa  151  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0267  Rhomboid family protein  41.21 
 
 		 224 aa  148  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0999  membrane protein-like protein  43.02 
 
 		 214 aa  141  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2245  Rhomboid family protein  41.58 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.927336  normal  0.19661 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1218  rhomboid-like protein  40.76 
 
 		 192 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01334  Rhomboid-like protein  41.48 
 
 		 179 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0870  rhomboid family protein  41.86 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1292  Rhomboid family protein  37.06 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1014  Rhomboid family protein  41.62 
 
 		 211 aa  124  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0816  rhomboid family protein  36.02 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1699  Rhomboid family protein  35.32 
 
 		 238 aa  122  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109717  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29150  uncharacterized membrane protein  38.42 
 
 		 192 aa  118  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.77593 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1781  rhomboid-like protein protein  40.36 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.138273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0518  rhomboid family protein  40.24 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137461  normal  0.0721678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3473  hypothetical protein  38.51 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000477638  normal  0.0111497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1968  Rhomboid family protein  38.51 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.579025  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4290  rhomboid family protein  34.05 
 
 		 225 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0810  Rhomboid family protein  33.7 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2355  rhomboid family protein  35.91 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11367  hypothetical protein  35.71 
 
 		 240 aa  106  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000159255  normal  0.565329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3785  rhomboid family protein  37.22 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1694  rhomboid-like protein  39.64 
 
 		 184 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.534876  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0855  hypothetical protein  35.6 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0886  hypothetical protein  35.08 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0020  Rhomboid family protein  37.74 
 
 		 242 aa  98.6  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.430888  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3847  rhomboid-like protein  33.13 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3921  rhomboid family protein  33.13 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3833  rhomboid family protein  33.13 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.123516 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3288  rhomboid family protein  35.58 
 
 		 188 aa  95.9  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.419904  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2190  rhomboid-like protein  33.33 
 
 		 256 aa  90.5  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1166  rhomboid family protein  32.53 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.270459  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05645  hypothetical protein  37.5 
 
 		 243 aa  85.5  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1238  Rhomboid family protein  34.13 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3385  rhomboid family protein  38.2 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.861601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0409  rhomboid family protein  32.58 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.48547  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03495  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  31.85 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17631  rhomboid family protein  28.74 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05140  uncharacterized membrane protein  29.95 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193508  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4037  Rhomboid family protein  29.6 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0760  hypothetical protein  30 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2256  rhomboid-like protein  31.3 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0526301 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0485  rhomboid family membrane serine protease  32.17 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12071  hypothetical protein  31.47 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1899  hypothetical protein  32.52 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.173429  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4233  rhomboid-like protein  27.11 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2134  rhomboid family protein  30.95 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00873022  decreased coverage  0.000000167975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  31.91 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  32.5 
 
 		 369 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  28.97 
 
 		 292 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  32.26 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0305  Rhomboid family protein  28.66 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000904763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  25.64 
 
 		 248 aa  41.6  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  30.14 
 
 		 554 aa  41.6  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  31.54 
 
 		 223 aa  41.2  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>