More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1288 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  76.71 
 
 
509 aa  725  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  70.39 
 
 
511 aa  655  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 
501 aa  978  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  65.95 
 
 
509 aa  602  1e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  67.82 
 
 
509 aa  598  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  61.15 
 
 
529 aa  595  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4863  cobyric acid synthase  68 
 
 
508 aa  577  1e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00498054  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  63.9 
 
 
575 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2603  cobyric acid synthase  64.68 
 
 
520 aa  570  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.478422  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  64.53 
 
 
521 aa  565  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  60.32 
 
 
512 aa  536  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  61.94 
 
 
498 aa  532  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  61.51 
 
 
486 aa  528  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  60.12 
 
 
495 aa  520  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  60.08 
 
 
491 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  61.26 
 
 
527 aa  509  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2034  cobyric acid synthase  60.49 
 
 
495 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  58.93 
 
 
494 aa  502  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2051  cobyric acid synthase  60.49 
 
 
495 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2097  cobyric acid synthase  60.49 
 
 
495 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0722506  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  55.6 
 
 
517 aa  501  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  58.6 
 
 
490 aa  493  1e-138  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  58.85 
 
 
476 aa  488  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  56.21 
 
 
507 aa  481  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  58.13 
 
 
499 aa  471  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0309  cobyric acid synthase  58.27 
 
 
501 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  45.99 
 
 
506 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  45.6 
 
 
513 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  45.6 
 
 
506 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  45.6 
 
 
506 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  45.79 
 
 
506 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  40 
 
 
494 aa  403  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  48.11 
 
 
518 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  45.54 
 
 
517 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  45.01 
 
 
485 aa  394  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  41.41 
 
 
514 aa  392  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  40.69 
 
 
513 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  45.78 
 
 
500 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  50.2 
 
 
496 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  48.57 
 
 
484 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  44.06 
 
 
491 aa  384  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  46.67 
 
 
484 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  48.37 
 
 
484 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  45.6 
 
 
491 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  48.16 
 
 
484 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  49.3 
 
 
485 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  48.7 
 
 
495 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  43.82 
 
 
541 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  44.47 
 
 
863 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  44.69 
 
 
858 aa  379  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  49.08 
 
 
490 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  41.99 
 
 
506 aa  380  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  44.02 
 
 
541 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  48.78 
 
 
484 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  44.38 
 
 
475 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  43.59 
 
 
541 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  43.11 
 
 
495 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  42.83 
 
 
556 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  49.08 
 
 
510 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  42.91 
 
 
534 aa  378  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  39.65 
 
 
507 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  46.34 
 
 
491 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  43.63 
 
 
565 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  44.13 
 
 
485 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  44.22 
 
 
490 aa  376  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  41.29 
 
 
503 aa  375  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  43.41 
 
 
777 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  42.86 
 
 
560 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  48.47 
 
 
490 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  43.08 
 
 
526 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  49.59 
 
 
485 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  45.34 
 
 
852 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  43.87 
 
 
510 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  45.61 
 
 
551 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  43.98 
 
 
536 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  43.66 
 
 
508 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  41.29 
 
 
503 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  42.86 
 
 
787 aa  372  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  43.87 
 
 
772 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  44.2 
 
 
494 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  45.86 
 
 
485 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  42.77 
 
 
495 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  47.36 
 
 
481 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  40.52 
 
 
501 aa  367  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  43.3 
 
 
503 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  48.07 
 
 
487 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  43.9 
 
 
863 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  45.25 
 
 
502 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  45.47 
 
 
489 aa  369  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  42.77 
 
 
495 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  44.53 
 
 
776 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  48.38 
 
 
481 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  41.22 
 
 
515 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  47.01 
 
 
486 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  48.78 
 
 
477 aa  364  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  45.03 
 
 
489 aa  364  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  45.26 
 
 
797 aa  364  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0815  cobyric acid synthase CobQ  48.27 
 
 
483 aa  364  2e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  42.12 
 
 
500 aa  363  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  47.15 
 
 
481 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>