More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1250 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  59.89 
 
 
537 aa  660    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  58.22 
 
 
555 aa  637    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  63.4 
 
 
547 aa  678    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  60 
 
 
536 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  58.76 
 
 
535 aa  659    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  60.08 
 
 
542 aa  679    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  59.43 
 
 
535 aa  664    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  60.98 
 
 
541 aa  677    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  59.25 
 
 
535 aa  662    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  59.62 
 
 
535 aa  666    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  59.25 
 
 
535 aa  663    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  61.7 
 
 
533 aa  687    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  59.43 
 
 
535 aa  665    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  58.3 
 
 
536 aa  666    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  61.93 
 
 
534 aa  672    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  59.62 
 
 
535 aa  666    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  58.27 
 
 
555 aa  638    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  63.84 
 
 
540 aa  677    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  60.15 
 
 
545 aa  655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  59.74 
 
 
558 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  59.2 
 
 
534 aa  645    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  59.4 
 
 
549 aa  640    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  62.26 
 
 
533 aa  685    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  59.21 
 
 
549 aa  636    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  60.23 
 
 
538 aa  654    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  100 
 
 
530 aa  1081    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08750  CTP synthetase  58.65 
 
 
535 aa  642    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  unclonable  0.00000000194145 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  59.62 
 
 
535 aa  666    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  59.81 
 
 
532 aa  647    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  58.76 
 
 
546 aa  639    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2106  CTP synthetase  59.21 
 
 
533 aa  635    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0473416  normal  0.014711 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  63.28 
 
 
537 aa  693    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  61.91 
 
 
535 aa  673    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  56.65 
 
 
534 aa  643    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  60.42 
 
 
534 aa  638    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  62.26 
 
 
555 aa  663    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  60.57 
 
 
533 aa  638    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  59.43 
 
 
535 aa  664    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  58.29 
 
 
547 aa  637    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  61.84 
 
 
536 aa  677    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  58.6 
 
 
554 aa  644    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  60.19 
 
 
533 aa  634    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  61.89 
 
 
547 aa  665    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  59.59 
 
 
531 aa  678    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  60 
 
 
545 aa  640    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  60.19 
 
 
551 aa  635    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  60.75 
 
 
531 aa  672    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  62.83 
 
 
557 aa  674    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  60.68 
 
 
535 aa  670    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  60.68 
 
 
535 aa  670    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  60.19 
 
 
535 aa  676    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  58.93 
 
 
571 aa  638    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  59.43 
 
 
542 aa  665    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  61.7 
 
 
547 aa  664    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  60.19 
 
 
559 aa  651    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  59.62 
 
 
534 aa  654    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  60.75 
 
 
558 aa  661    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  59.06 
 
 
535 aa  661    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  59.21 
 
 
555 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  59.43 
 
 
535 aa  665    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  60.08 
 
 
532 aa  660    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  61.17 
 
 
538 aa  675    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  58.3 
 
 
546 aa  649    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  60.87 
 
 
547 aa  656    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  58.3 
 
 
536 aa  666    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  57.06 
 
 
534 aa  632  1e-180  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  57.78 
 
 
552 aa  632  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  58.1 
 
 
555 aa  633  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  58.71 
 
 
535 aa  629  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  57.84 
 
 
536 aa  631  1e-179  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  57.73 
 
 
550 aa  628  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  58.08 
 
 
545 aa  629  1e-179  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  57.84 
 
 
536 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  57.51 
 
 
555 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  61.06 
 
 
549 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  56.06 
 
 
533 aa  629  1e-179  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  57.04 
 
 
553 aa  628  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  57.43 
 
 
557 aa  630  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  57.66 
 
 
536 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  55.95 
 
 
535 aa  625  1e-178  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.357981 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  56.55 
 
 
533 aa  627  1e-178  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  58.9 
 
 
535 aa  627  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  55.93 
 
 
542 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  55.99 
 
 
533 aa  624  1e-177  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  56.18 
 
 
533 aa  623  1e-177  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  57.59 
 
 
546 aa  621  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  56.25 
 
 
534 aa  622  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  55.93 
 
 
543 aa  621  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  55.3 
 
 
539 aa  623  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  57.25 
 
 
540 aa  621  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  55.93 
 
 
542 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  55.74 
 
 
542 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  55.93 
 
 
543 aa  618  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  56.51 
 
 
550 aa  619  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  55.74 
 
 
542 aa  621  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  56.11 
 
 
543 aa  621  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  57.41 
 
 
549 aa  618  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  53.6 
 
 
539 aa  618  1e-176  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  57.09 
 
 
536 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  56.24 
 
 
545 aa  619  1e-176  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>