More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1566 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  100 
 
 
216 aa  425  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  99.07 
 
 
216 aa  422  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  39.27 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  39.01 
 
 
216 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  39.46 
 
 
223 aa  117  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  34.2 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  36.81 
 
 
256 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
220 aa  115  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  35.2 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  35.16 
 
 
220 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.38 
 
 
217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  33.68 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.18 
 
 
227 aa  108  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  31.69 
 
 
216 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.43 
 
 
223 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.31 
 
 
219 aa  106  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  32.28 
 
 
219 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  32.35 
 
 
227 aa  105  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  34.62 
 
 
215 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.58 
 
 
223 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  32.35 
 
 
230 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  31.36 
 
 
226 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  30.7 
 
 
216 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.11 
 
 
213 aa  102  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  31.88 
 
 
228 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  35.64 
 
 
232 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  33.89 
 
 
218 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  36.56 
 
 
221 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  32.98 
 
 
209 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.03 
 
 
217 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  34.22 
 
 
222 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.52 
 
 
217 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.71 
 
 
220 aa  99.8  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  33.15 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.7 
 
 
225 aa  99.4  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.15 
 
 
235 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  30.21 
 
 
217 aa  99  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  31.78 
 
 
396 aa  99  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.49 
 
 
218 aa  98.2  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  34.08 
 
 
728 aa  98.2  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  32.42 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  35.11 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  31.07 
 
 
271 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.69 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  35.2 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  34.04 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.15 
 
 
235 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  35.2 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4056  HAD family hydrolase  33.15 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  31.82 
 
 
241 aa  97.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  35.2 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.07 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.22 
 
 
201 aa  97.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0931  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.11 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22053  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  33.49 
 
 
232 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  33.15 
 
 
188 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  33.15 
 
 
188 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
202 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  33.15 
 
 
188 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.6 
 
 
188 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  30.52 
 
 
228 aa  95.5  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
202 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  33.52 
 
 
188 aa  95.5  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
202 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  32.22 
 
 
219 aa  94.7  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  32.5 
 
 
456 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2048  HAD family hydrolase  31.87 
 
 
238 aa  94.4  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539587  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  32.07 
 
 
456 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  34.04 
 
 
228 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  32.6 
 
 
188 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  28.22 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  32.6 
 
 
188 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0990  HAD family hydrolase  32.64 
 
 
253 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.480228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  32.96 
 
 
221 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4356  HAD family hydrolase  31.98 
 
 
233 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.582602 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  32.6 
 
 
188 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2125  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.02 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0177126  hitchhiker  0.00144451 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  28.22 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0953  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.64 
 
 
253 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  32.6 
 
 
188 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  28.22 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  29.8 
 
 
225 aa  93.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.64 
 
 
235 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  30.94 
 
 
188 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  33.15 
 
 
220 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.58 
 
 
202 aa  93.2  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  32.28 
 
 
207 aa  93.2  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  30.39 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  28.22 
 
 
219 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  31.94 
 
 
236 aa  92.8  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0272  HAD-superfamily hydrolase  31.55 
 
 
221 aa  92.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  30.39 
 
 
188 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  29.33 
 
 
228 aa  92.8  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13910  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  33.52 
 
 
232 aa  92.8  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.491881  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  31.87 
 
 
222 aa  92.8  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  30.39 
 
 
188 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  30.37 
 
 
262 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  29.7 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  30.7 
 
 
227 aa  92  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0123656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  28.22 
 
 
219 aa  92  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>