More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1746 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1746  glycine cleavage H-protein  100 
 
 		 150 aa  312  8e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.342973  normal  0.262336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3134  glycine cleavage H-protein  90.67 
 
 		 150 aa  288  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2490  glycine cleavage H-protein  61.22 
 
 		 148 aa  205  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2869  glycine cleavage system H protein, putative  61.22 
 
 		 148 aa  205  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1076  glycine cleavage system protein H  42.86 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510975  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2177  glycine cleavage H-protein  47.59 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000031691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2549  glycine cleavage system protein H, putative  47.59 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2210  glycine cleavage H-protein  51.75 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00775002  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1481  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.14622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0638  glycine cleavage H-protein  45.45 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1073  glycine cleavage system protein H  39.58 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000237871  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2035  glycine cleavage H-protein  38.19 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0973  glycine cleavage H-protein  37.76 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.714694  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2208  glycine cleavage H-protein  40.6 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0640  glycine cleavage H-protein  38.4 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2175  glycine cleavage H-protein  38.4 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000381106 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2547  glycine cleavage system H protein, putative  38.4 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0974  glycine cleavage H-protein  37.5 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357877  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  37.84 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  37.84 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0438  glycine cleavage system H protein  32.86 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0225  glycine cleavage system H protein  38.1 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000351635  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  38.79 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  38.68 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  42.45 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  42.11 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3004  glycine cleavage system protein H  43.4 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.655553 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2348  glycine cleavage system H protein  34.86 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  37.84 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  37.61 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  37.61 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  37.61 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2078  glycine cleavage H-protein  34.55 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  37.04 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  38.89 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  37.04 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  38.53 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  35.78 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  35.14 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  37.61 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3881  glycine cleavage system protein H  41.35 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  35.78 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  34.86 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  34.86 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  35.96 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  35.96 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  36.7 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  36.84 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  33.94 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  32.41 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  33.94 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  38.1 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  33.94 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  33.94 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32985  glycine cleavage system protein H  43.14 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0356565  hitchhiker  0.0000202177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2804  glycine cleavage system protein H  43.14 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0629199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  32.31 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63370  hypothetical protein  32.82 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  34.71 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  38.46 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  33.87 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  34.91 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  35.48 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  38.46 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  34.91 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  33.94 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  35.09 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  33.02 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  33.96 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  33.94 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  33.62 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  33.94 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  33.94 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  34.29 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1346  glycine cleavage system protein H  40.78 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  33.94 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  34.91 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  37.96 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5518  hypothetical protein  32.06 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3096  glycine cleavage system protein H  38.78 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  34.29 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  34.29 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1417  glycine cleavage system H protein  34 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  33.94 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  35.34 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>