217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0069 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
475 aa  945  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  70.46 
 
 
465 aa  584  1e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  4.59278e-12 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  68.56 
 
 
468 aa  575  1e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  53.15 
 
 
462 aa  429  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  47.39 
 
 
463 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  47.64 
 
 
471 aa  408  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  50.83 
 
 
439 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  50.82 
 
 
461 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  47.42 
 
 
471 aa  406  1e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  46.52 
 
 
461 aa  406  1e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  49.89 
 
 
466 aa  405  1e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  47.44 
 
 
465 aa  407  1e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  46.41 
 
 
471 aa  405  1e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  47.96 
 
 
463 aa  407  1e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  53.86 
 
 
450 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  48.74 
 
 
466 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  44.49 
 
 
472 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  48.4 
 
 
466 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  45.62 
 
 
471 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  45.62 
 
 
471 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  46.62 
 
 
465 aa  391  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  49.46 
 
 
478 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  44.07 
 
 
478 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  43.35 
 
 
472 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  43.79 
 
 
476 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  45.42 
 
 
475 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  48.69 
 
 
415 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  48.95 
 
 
447 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  48.46 
 
 
417 aa  368  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  48.39 
 
 
449 aa  363  5e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  45.11 
 
 
478 aa  362  6e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  47.52 
 
 
441 aa  360  3e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0214  major facilitator superfamily MFS_1  47.9 
 
 
444 aa  354  2e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131109  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  45.62 
 
 
462 aa  349  5e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  47.23 
 
 
429 aa  339  5e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4383  ampG protein, putative  41.75 
 
 
516 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.920569  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4078  AmpG-related permease  41.41 
 
 
516 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  41.58 
 
 
504 aa  328  1e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  40.96 
 
 
515 aa  327  3e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  40.46 
 
 
482 aa  323  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  40.93 
 
 
482 aa  321  2e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  39.96 
 
 
457 aa  315  1e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1198  AmpG permease  40.16 
 
 
519 aa  312  8e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0962  AmpG-related permease  40.4 
 
 
515 aa  310  3e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4494  AmpG-related permease  39.35 
 
 
515 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769685  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1355  AmpG-related permease  40.61 
 
 
515 aa  305  9e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.010612  normal  0.140605 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4369  AmpG-related permease  40.61 
 
 
515 aa  305  1e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  40.61 
 
 
443 aa  303  5e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  40.47 
 
 
447 aa  300  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  41.47 
 
 
461 aa  297  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  37.94 
 
 
456 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  37.92 
 
 
454 aa  296  8e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  37.06 
 
 
459 aa  293  6e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  37.58 
 
 
457 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  39.69 
 
 
460 aa  285  1e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  38.58 
 
 
452 aa  284  2e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  39.15 
 
 
455 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  40.65 
 
 
452 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  35.73 
 
 
550 aa  278  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1156  major facilitator transporter  35.73 
 
 
553 aa  272  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0968602  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5113  major facilitator superfamily MFS_1  42.08 
 
 
463 aa  266  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  37.53 
 
 
431 aa  263  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  37.72 
 
 
412 aa  260  5e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  38.94 
 
 
388 aa  258  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  40.92 
 
 
443 aa  256  9e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  35.33 
 
 
428 aa  254  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  32.49 
 
 
447 aa  248  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  31.95 
 
 
450 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  38.14 
 
 
411 aa  244  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1420  major facilitator superfamily MFS_1  36.91 
 
 
438 aa  241  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508599 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  36.18 
 
 
419 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 
416 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  36.2 
 
 
450 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  36.01 
 
 
429 aa  236  7e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1667  major facilitator transporter  31.73 
 
 
451 aa  235  1e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0579205  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1889  putative ampG protein  31.12 
 
 
462 aa  235  1e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  35.78 
 
 
429 aa  235  2e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  34.88 
 
 
437 aa  234  2e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  34.44 
 
 
437 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  34.44 
 
 
437 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  34.44 
 
 
437 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  34.87 
 
 
492 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  34.44 
 
 
437 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  34.44 
 
 
437 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  34.44 
 
 
437 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  33.96 
 
 
495 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  34.44 
 
 
437 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  33.96 
 
 
495 aa  231  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  34.87 
 
 
492 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  34.87 
 
 
492 aa  230  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.35083e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  50.99 
 
 
1565 aa  229  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  36.3 
 
 
409 aa  229  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  50.99 
 
 
1565 aa  229  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  31.98 
 
 
473 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  34.45 
 
 
492 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  2.07294e-06  hitchhiker  5.12549e-06 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1449  major facilitator transporter  34.77 
 
 
453 aa  227  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03281  hypothetical protein  32.35 
 
 
409 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  35.9 
 
 
426 aa  224  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  36.42 
 
 
426 aa  223  5e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  32.19 
 
 
473 aa  223  5e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>