More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0049 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0049  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  100 
 
 
365 aa  723  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3261  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  57.47 
 
 
355 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5858  two-component sensor NtrB  49.28 
 
 
358 aa  319  6e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0416  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  48.99 
 
 
361 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.994306 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67670  two-component sensor NtrB  48.99 
 
 
358 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0340  Signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  48.41 
 
 
361 aa  316  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5047  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  48.99 
 
 
361 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0735  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.67 
 
 
385 aa  315  7e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0331289  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4922  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  48.7 
 
 
361 aa  314  1e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5100  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  48.7 
 
 
361 aa  314  1e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4821  sensor histidine kinase  48.14 
 
 
361 aa  313  2e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0015  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  50.58 
 
 
350 aa  314  2e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.327507  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0353  nitrogen regulation protein NtrB  47.85 
 
 
361 aa  312  6e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.99 
 
 
357 aa  310  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000409707  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1216  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  49.86 
 
 
357 aa  309  4e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0245  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  47.43 
 
 
365 aa  309  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.41 
 
 
362 aa  306  4e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45890  histidine protein kinase, nitrogen regulation protein NtrB (NR(II))  48.85 
 
 
361 aa  305  6e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0767  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.28 
 
 
374 aa  297  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3650  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  47.89 
 
 
358 aa  296  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.051036  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3560  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.53 
 
 
351 aa  296  3e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2449  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.7 
 
 
365 aa  294  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000168694  normal  0.861586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3759  sensor histidine kinase  44.51 
 
 
356 aa  289  5e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2542  nitrogen regulation protein NR(II)  48.25 
 
 
364 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0283  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.06 
 
 
346 aa  287  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  3.23653e-07 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4650  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.95 
 
 
348 aa  286  4e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.617913 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01589  nitrogen regulation protein NR(II)  45.35 
 
 
361 aa  283  2e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0257  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.97 
 
 
381 aa  283  2e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0259  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.49 
 
 
348 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0267  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.78 
 
 
348 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0267  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.78 
 
 
348 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0262  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.49 
 
 
348 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.507954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0258  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.06 
 
 
348 aa  275  8e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3763  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.06 
 
 
348 aa  275  8e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0259  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.06 
 
 
348 aa  275  9e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.627159  hitchhiker  1.91471e-06 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0321  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.73 
 
 
345 aa  274  2e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4471  nitrogen regulation protein  45.8 
 
 
348 aa  273  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0398  nitrogen regulation protein NR(II)  43.73 
 
 
371 aa  270  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.737334  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3457  ATP-binding region, ATPase-like protein  43.6 
 
 
345 aa  270  3e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0871385  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1254  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.75 
 
 
377 aa  270  3e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00721446  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001907  nitrogen regulation protein NR(II)  44.73 
 
 
348 aa  270  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1111  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.73 
 
 
362 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1191  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.73 
 
 
362 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.310962  normal  0.462311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5000  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.38 
 
 
358 aa  266  3e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1444  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.15 
 
 
361 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.852628  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2981  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.06 
 
 
368 aa  265  9e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0372  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.09 
 
 
348 aa  265  9e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2074  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.18 
 
 
373 aa  265  9e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.673281 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3426  nitrogen regulation protein  44.31 
 
 
348 aa  265  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.204004 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00585  nitrogen regulation protein NR(II)  45.06 
 
 
336 aa  265  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3487  sensor histidine kinase  43.44 
 
 
356 aa  264  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0596493 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1260  nitrogen regulation(sensor protein kinase transcription regulator  43.56 
 
 
361 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578512  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1809  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.77 
 
 
366 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.7833  hitchhiker  3.12288e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3929  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.03 
 
 
346 aa  261  9e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3583  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.19 
 
 
357 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.998246 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2778  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.66 
 
 
365 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549805  normal  0.0478149 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3152  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.83 
 
 
363 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2501  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 
363 aa  260  3e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1027  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.16 
 
 
359 aa  259  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1634  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.77 
 
 
359 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2614  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.66 
 
 
380 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.082338  normal  0.678018 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2060  signal transduction histidine kinase NtrB  42.9 
 
 
387 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281359  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1523  putative nitrogen regulation, histidine kinase, protein NR(II)  42.37 
 
 
380 aa  255  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000460807  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2520  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.7 
 
 
361 aa  254  1e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2902  nitrogen regulation protein NR(II)  42.7 
 
 
361 aa  254  1e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2320  nitrogen regulation protein NR(II)  44.74 
 
 
354 aa  254  2e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2055  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.36 
 
 
393 aa  254  2e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512531  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5457  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.69 
 
 
380 aa  253  4e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1088  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.45 
 
 
400 aa  252  8e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.943644  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2185  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.12 
 
 
380 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374753  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2166  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.41 
 
 
380 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2148  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.41 
 
 
380 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2058  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.12 
 
 
380 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.778281  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5929  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.41 
 
 
380 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.516447  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1181  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.33 
 
 
399 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1845  nitrogen regulation protein  42.98 
 
 
395 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4288  nitrogen regulation protein NR(II)  43.82 
 
 
349 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4217  nitrogen regulation protein NR(II)  43.82 
 
 
349 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732813  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4238  nitrogen regulation protein NR(II)  43.82 
 
 
349 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.893304  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4334  nitrogen regulation protein NR(II)  43.82 
 
 
349 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1123  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.98 
 
 
393 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.25113 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2689  nitrogen regulation protein NR(II)  42.82 
 
 
380 aa  249  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1741  nitrogen regulation protein  42.82 
 
 
357 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.546015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2251  nitrogen regulation protein NR(II)  42.82 
 
 
380 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1480  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.24 
 
 
380 aa  248  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3068  nitrogen regulation protein NR(II)  42.82 
 
 
380 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2633  nitrogen regulation protein NR(II)  42.82 
 
 
380 aa  249  8e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.90491  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2768  nitrogen regulation protein  42.69 
 
 
395 aa  249  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1523  nitrogen regulation protein NR(II)  42.82 
 
 
380 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4395  nitrogen regulation protein NR(II)  43.53 
 
 
349 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4097  nitrogen regulation protein NR(II)  43.5 
 
 
349 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4147  nitrogen regulation protein NR(II)  43.84 
 
 
349 aa  246  5e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5315  nitrogen regulation protein NR(II)  43.84 
 
 
349 aa  246  5e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.962522  normal  0.565649 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03754  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with GlnG  43.84 
 
 
349 aa  246  5e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4117  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.84 
 
 
349 aa  246  5e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4391  nitrogen regulation protein NR(II)  43.84 
 
 
349 aa  246  5e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.132536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4254  nitrogen regulation protein NR(II)  43.84 
 
 
349 aa  246  5e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.388785 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03703  hypothetical protein  43.84 
 
 
349 aa  246  5e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4096  nitrogen regulation protein NR(II)  43.84 
 
 
349 aa  246  5e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4345  nitrogen regulation protein NR(II)  43.55 
 
 
349 aa  243  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>