146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2290 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2290  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 208 aa  415  9.999999999999999e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0340  transcriptional regulator, CarD family  36.31 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.18012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00900  transcriptional regulator, CarD family  37.25 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.92061e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1516  transcriptional regulator, CarD family  36.14 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0173  transcriptional regulator, CarD family  35.29 
 
 		 159 aa  105  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0392  transcriptional regulator, CarD family  38.3 
 
 		 158 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000362697  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2940  CarD family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 158 aa  104  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0259  transcriptional regulator, CarD family  32.68 
 
 		 158 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000116082  normal  0.0229238 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0359  putative transcription factor  37.5 
 
 		 162 aa  101  1e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0436176  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0185  CarD family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 158 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164199  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2786  CarD family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 364 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0756679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0184  CarD family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 158 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000461905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3388  CarD family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 159 aa  94.4  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0399  transcriptional regulator, CarD family  34.23 
 
 		 159 aa  93.2  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00433509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4447  CarD family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 164 aa  91.3  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.948938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4833  transcriptional regulator, CarD family  34.53 
 
 		 164 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4465  CarD family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 164 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4857  CarD family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 164 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4851  transcriptional regulator, CarD family  34.53 
 
 		 164 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.906261  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0970  transcription factor CarD  30.71 
 
 		 162 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0421613  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3038  transcriptional regulator, CarD family  30.32 
 
 		 404 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.175177  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0553  CarD family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 186 aa  89.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.106892 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2944  transcriptional regulator, CarD family  30.32 
 
 		 404 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.070687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1560  transcriptional regulator, CarD family  32.24 
 
 		 158 aa  89  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.879343  normal  0.22005 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2489  CarD family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 158 aa  88.6  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00883814  normal  0.0681247 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2498  CarD family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 171 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860997  hitchhiker  0.00028149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1271  CarD family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 171 aa  88.2  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0355661  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2685  transcriptional regulator, CarD family  30.92 
 
 		 171 aa  88.2  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000114953  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2592  transcriptional regulator, CarD family  30.92 
 
 		 171 aa  88.2  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0112448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3756  transcriptional regulator, CarD family  32.24 
 
 		 158 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03770  transcriptional regulator, CarD family  29.87 
 
 		 160 aa  88.2  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0832449  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4522  transcriptional regulator, CarD family  33.55 
 
 		 162 aa  88.2  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76792  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4611  CarD family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 153 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2857  CarD family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 399 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.031457  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0842  transcriptional regulator, CarD family  32.48 
 
 		 174 aa  87.8  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000502927  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4967  CarD family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 148 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0352786  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0726  CarD family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 160 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1687  transcriptional regulator, CarD family  33.33 
 
 		 171 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal  0.385121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4262  transcription factor CarD  33.11 
 
 		 161 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0852  transcriptional regulator, CarD family  31.94 
 
 		 160 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4692  CarD family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 161 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0703  transcriptional regulator, CarD family  29.87 
 
 		 160 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0540347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3335  CarD family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 158 aa  86.3  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3438  CarD family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 158 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.270269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3350  CarD family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 158 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3708  CarD family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 158 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1901  transcriptional regulator, CarD family  30.92 
 
 		 159 aa  85.9  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.488949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3658  transcriptional regulator, CarD family  32.24 
 
 		 158 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2164  transcriptional regulator, CarD family  31.79 
 
 		 153 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0104  putative transcriptional regulator  31.47 
 
 		 161 aa  85.1  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3676  CarD family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 158 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3401  CarD family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 158 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4040  CarD family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3681  transcriptional regulator, CarD family  31.58 
 
 		 158 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0786327  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1766  transcriptional regulator, putative  32.02 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000100794  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1455  transcriptional regulator, CarD family  30.61 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000871292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1702  putative transcriptional regulator  32.02 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000176532  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0898  transcriptional regulator, CarD family  29.58 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03720  transcriptional regulator, CarD family  27.27 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4546  CarD family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0963  CarD family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2129  CarD family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000417327  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0676  transcriptional regulator, CarD family  31.21 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000026469  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0489  transcriptional regulator, CarD family  35.37 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0773  transcriptional regulator, CarD family  29.61 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164526  normal  0.216229 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0123  CarD family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0548  CarD family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 365 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.300109  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4143  transcriptional regulator, CarD family  32.72 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239678  normal  0.0810654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3814  transcriptional regulator, CarD family  32.72 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09270  transcriptional regulator, CarD family  28.29 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7543  CarD family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 278 aa  81.3  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.330727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4319  transcriptional regulator, CarD family  29.61 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2880  CarD family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 158 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2907  CarD family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 160 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1561  CarD family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 171 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0294353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0501  CarD family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 163 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0364  transcriptional regulator, CarD family  30.99 
 
 		 162 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0409  transcriptional regulator, CarD family  33.56 
 
 		 164 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4255  CarD family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5340  CarD family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0362  CarD family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0755625  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1065  CarD family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0695746  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0164  transcriptional regulator, CarD family  29.79 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.475576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0490  transcriptional regulator, CarD family  29.3 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00257809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0142  transcriptional regulator, CarD family  30.2 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.432895  normal  0.208842 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2077  transcriptional regulator, CarD family  29.33 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.90671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4352  transcriptional regulator CarD family  32.1 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4740  CarD family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4826  CarD family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.652741  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5126  CarD family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.593452 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1444  CarD family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0551  CarD family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 429 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207185  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13616  transcription factor  28.17 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35090  transcriptional regulator, CarD family  30.99 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.86286 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0507  CarD family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0122387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0651  transcriptional regulator, CarD family  30.71 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0278  transcription factor CarD  34.46 
 
 		 432 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1694  CarD family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 350 aa  78.2  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.132221 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2959  transcriptional regulator, CarD family  28.87 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4827  transcriptional regulator, CarD family  33.81 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>