150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1516 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1516  transcriptional regulator, CarD family  100 
 
 		 191 aa  374  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2290  transcriptional regulator, putative  36.14 
 
 		 208 aa  108  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00900  transcriptional regulator, CarD family  30.63 
 
 		 176 aa  97.8  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.92061e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0173  transcriptional regulator, CarD family  28.03 
 
 		 159 aa  95.5  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0259  transcriptional regulator, CarD family  29.3 
 
 		 158 aa  95.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000116082  normal  0.0229238 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2907  CarD family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 160 aa  94  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0124  CarD family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0247  CarD family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 175 aa  92.8  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.246568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0703  transcriptional regulator, CarD family  30.13 
 
 		 160 aa  90.9  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0540347  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0501  CarD family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 163 aa  89.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3537  CarD family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0676  transcriptional regulator, CarD family  33.94 
 
 		 176 aa  90.1  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000026469  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4319  transcriptional regulator, CarD family  30.13 
 
 		 160 aa  90.1  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0601  transcriptional regulator, CarD family  29.81 
 
 		 162 aa  89.4  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0553  CarD family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.106892 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0185  CarD family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164199  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0970  transcription factor CarD  28.12 
 
 		 162 aa  89.4  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0421613  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2786  CarD family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 364 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0756679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0340  transcriptional regulator, CarD family  29.33 
 
 		 159 aa  89  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.18012  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13616  transcription factor  29.81 
 
 		 162 aa  89  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0963  CarD family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 160 aa  88.6  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0184  CarD family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 158 aa  88.2  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000461905  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2940  CarD family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 158 aa  88.2  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1694  CarD family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 350 aa  87.8  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.132221 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0399  transcriptional regulator, CarD family  31.65 
 
 		 159 aa  87  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00433509  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1444  CarD family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0142  transcriptional regulator, CarD family  30.19 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.432895  normal  0.208842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0364  transcriptional regulator, CarD family  29.19 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0392  transcriptional regulator, CarD family  29.94 
 
 		 158 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000362697  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5340  CarD family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 162 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35090  transcriptional regulator, CarD family  29.38 
 
 		 163 aa  86.7  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.86286 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1901  transcriptional regulator, CarD family  31.41 
 
 		 159 aa  86.7  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.488949  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4740  CarD family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 162 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4826  CarD family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 162 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.652741  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5126  CarD family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 162 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.593452 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1455  transcriptional regulator, CarD family  29.22 
 
 		 171 aa  85.9  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000871292  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09270  transcriptional regulator, CarD family  30.77 
 
 		 160 aa  85.5  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1245  transcriptional regulator, CarD family  30.43 
 
 		 168 aa  84.7  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000622315  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2489  CarD family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 158 aa  84.3  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00883814  normal  0.0681247 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4447  CarD family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 164 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.948938  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4465  CarD family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 164 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2857  CarD family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.031457  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4262  transcription factor CarD  29.38 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0786  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 170 aa  84.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000100342  normal  0.0526342 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4692  CarD family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2944  transcriptional regulator, CarD family  27.11 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.070687  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3038  transcriptional regulator, CarD family  27.11 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.175177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4833  transcriptional regulator, CarD family  28.37 
 
 		 164 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4857  CarD family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4851  transcriptional regulator, CarD family  28.37 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.906261  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4255  CarD family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3379  CarD family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818177  n/a   
 
 
 
NC_009664  Krad_0898  transcriptional regulator, CarD family  29.49 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0362  CarD family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0755625  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0164  transcriptional regulator, CarD family  28.66 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.475576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0866  transcriptional regulator, CarD family  29.11 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.795809 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0751  transcriptional_regulator  32.47 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024387  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0104  putative transcriptional regulator  30.72 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4546  CarD family transcriptional regulator  30 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4967  CarD family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0352786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3388  CarD family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2425  CarD family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.0000259686  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1089  CarD family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1557  CarD family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0842  transcriptional regulator, CarD family  30.36 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000502927  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4522  transcriptional regulator, CarD family  28.95 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4827  transcriptional regulator, CarD family  27.44 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3676  CarD family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4611  CarD family transcriptional regulator  30 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2129  CarD family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000417327  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1718  transcriptional regulator, CarD family  27.07 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1825  CarD family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  unclonable  0.00000000000495809  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0651  transcriptional regulator, CarD family  28.21 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0490  transcriptional regulator, CarD family  29.59 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00257809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0548  CarD family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.300109  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0409  transcriptional regulator, CarD family  27.44 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3308  CarD family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178714  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0576  CarD family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.0000000000504519  unclonable  0.0000000218406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3112  CarD family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0000522164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0187  CarD family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3880  transcription factor CarD  29.01 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal  0.0799721 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3335  CarD family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512684  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4190  transcriptional regulator, CarD family  29.01 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.627659  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0551  CarD family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 429 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207185  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0726  CarD family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0852  transcriptional regulator, CarD family  28.03 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3708  CarD family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3756  transcriptional regulator, CarD family  27.14 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1560  transcriptional regulator, CarD family  27.14 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.879343  normal  0.22005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7543  CarD family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 278 aa  78.6  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.330727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0278  transcription factor CarD  29.01 
 
 		 432 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0489  transcriptional regulator, CarD family  29.01 
 
 		 278 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2498  CarD family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860997  hitchhiker  0.00028149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1271  CarD family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0355661  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2592  transcriptional regulator, CarD family  27.15 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0112448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2685  transcriptional regulator, CarD family  27.15 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000114953  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0078  CarD family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1134  CarD family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000250032  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4352  transcriptional regulator CarD family  29.09 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4337  transcriptional regulator, CarD family  28.05 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.529688 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>