32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2005 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2005  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  383  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0591138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 204 aa  91.7  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 203 aa  87.8  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 206 aa  85.9  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  29.89 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  28 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2627  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108473  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  22.22 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  20.86 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  29.57 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 219 aa  51.6  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  35.62 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  52.78 
 
 		 258 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  28.1 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  45.28 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  55.88 
 
 		 255 aa  41.2  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3840  nucleoid occlusion protein  41.51 
 
 		 197 aa  41.2  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00664895  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 226 aa  41.2  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0324  nucleoid occlusion protein  53.57 
 
 		 197 aa  41.2  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3831  nucleoid occlusion protein  53.57 
 
 		 197 aa  40.8  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0323  nucleoid occlusion protein  53.57 
 
 		 197 aa  40.8  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000549659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>