102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0216 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0216  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  818    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.380044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3723  hypothetical protein  41.08 
 
 		 411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1304  hypothetical protein  41.18 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00427648  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1122  hypothetical protein  41.03 
 
 		 388 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.003942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2883  hypothetical protein  35.48 
 
 		 400 aa  248  2e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0726  hypothetical protein  28.72 
 
 		 407 aa  199  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3162  SAM dependent methyltransferase  38.35 
 
 		 389 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3286  SAM-dependent methyltransferase  33.51 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3589  hypothetical protein  28.35 
 
 		 401 aa  186  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2704 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0632  hypothetical protein  34.93 
 
 		 404 aa  186  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.95994 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0378  hypothetical protein  27.49 
 
 		 401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2392  hypothetical protein  35.79 
 
 		 423 aa  182  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0414  SAM-dependent methyltransferase  30 
 
 		 394 aa  182  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.675076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0312  hypothetical protein  29.9 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0938935  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0449  hypothetical protein  26.65 
 
 		 392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114768  decreased coverage  0.00000434601 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3246  hypothetical protein  28.61 
 
 		 444 aa  179  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2170  SAM dependent methyltransferase  31.67 
 
 		 389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000185773  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4406  hypothetical protein  29.26 
 
 		 404 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3377  hypothetical protein  29.14 
 
 		 399 aa  166  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4318  hypothetical protein  29.34 
 
 		 404 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3894  hypothetical protein  29.2 
 
 		 399 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0440  hypothetical protein  28.85 
 
 		 399 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1046  hypothetical protein  28.75 
 
 		 409 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4017  hypothetical protein  29.2 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3821  hypothetical protein  28.61 
 
 		 401 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1010  hypothetical protein  30.42 
 
 		 420 aa  162  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.75207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5884  hypothetical protein  27.65 
 
 		 376 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4286  hypothetical protein  34.62 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3988  hypothetical protein  34.63 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3564  hypothetical protein  29.59 
 
 		 413 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0616674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1301  hypothetical protein  33.93 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87131  predicted protein  24.33 
 
 		 453 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00012796  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1388  hypothetical protein  36.48 
 
 		 316 aa  143  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2942  hypothetical protein  35.93 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3630  hypothetical protein  35.93 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2810  hypothetical protein  35.93 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3617  hypothetical protein  35.93 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0033  hypothetical protein  35.93 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1733  hypothetical protein  35.93 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3605  hypothetical protein  35.93 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3167  hypothetical protein  35.93 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46056  predicted protein  28.87 
 
 		 612 aa  137  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.268711  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0682  hypothetical protein  33.46 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.189745  normal  0.58708 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2734  hypothetical protein  35.37 
 
 		 276 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3560  hypothetical protein  35.19 
 
 		 277 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215657  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2456  hypothetical protein  35.06 
 
 		 277 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0871  hypothetical protein  35.93 
 
 		 285 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0423  hypothetical protein  35.04 
 
 		 280 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3535  hypothetical protein  35.47 
 
 		 280 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0781618  normal  0.194913 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3157  hypothetical protein  34.91 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3585  hypothetical protein  34.32 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4678  hypothetical protein  32.1 
 
 		 278 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.998314 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3601  hypothetical protein  32.1 
 
 		 278 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2608  hypothetical protein  33.9 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485441  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0402  hypothetical protein  33.9 
 
 		 303 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0497  hypothetical protein  33.9 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0470  hypothetical protein  33.9 
 
 		 296 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0428  hypothetical protein  33.9 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2900  hypothetical protein  33.05 
 
 		 296 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320076  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1797  hypothetical protein  33.99 
 
 		 273 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.534561 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3984  hypothetical protein  32.3 
 
 		 280 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4096  hypothetical protein  32.3 
 
 		 283 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4127  hypothetical protein  32.3 
 
 		 283 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1006  hypothetical protein  31.62 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3581  hypothetical protein  31.45 
 
 		 323 aa  121  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0436  hypothetical protein  29.86 
 
 		 277 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5571  hypothetical protein  32.28 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1208  hypothetical protein  31.45 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0625  hypothetical protein  30.08 
 
 		 316 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2930  hypothetical protein  30.16 
 
 		 286 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.778449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0532  hypothetical protein  30.8 
 
 		 307 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0707  hypothetical protein  29.88 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1150  hypothetical protein  30.9 
 
 		 294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93465  predicted protein  25.93 
 
 		 278 aa  54.3  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00870525 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2633  hypothetical protein  32.38 
 
 		 218 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00651403  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1367  23S rRNA methyltransferase A  27.5 
 
 		 269 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000667026  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2031  hypothetical protein  32.08 
 
 		 218 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000492464 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1821  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  26.88 
 
 		 269 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000864083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1912  23S rRNA methyltransferase A  26.88 
 
 		 269 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118014  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2087  23S rRNA methyltransferase A  26.88 
 
 		 269 aa  50.8  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000369097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2196  hypothetical protein  32.38 
 
 		 218 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00144783  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44877  predicted protein  24.73 
 
 		 476 aa  50.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01792  23S rRNA m1G745 methyltransferase  26.88 
 
 		 269 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000732176  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1810  23S rRNA methyltransferase A  26.88 
 
 		 269 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00511797  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2552  23S rRNA methyltransferase A  26.88 
 
 		 269 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000580084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01780  hypothetical protein  26.88 
 
 		 269 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000118677  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2534  hypothetical protein  30.77 
 
 		 237 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2049  23S rRNA methyltransferase A  26.25 
 
 		 269 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258454  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 254 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50474  predicted protein  27.14 
 
 		 747 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0241823  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49556  predicted protein  28.93 
 
 		 541 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4150  hypothetical protein  30.1 
 
 		 220 aa  47  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.8 
 
 		 254 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  27.47 
 
 		 250 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3309  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  26.02 
 
 		 272 aa  44.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.260983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  25.77 
 
 		 254 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  20.41 
 
 		 275 aa  43.9  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  25.74 
 
 		 254 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  25 
 
 		 263 aa  43.5  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  25 
 
 		 263 aa  43.5  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>