89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3246 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3246  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  899    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143918  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4286  hypothetical protein  53.48 
 
 		 406 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4406  hypothetical protein  56.13 
 
 		 404 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3988  hypothetical protein  52.76 
 
 		 406 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4318  hypothetical protein  54.95 
 
 		 404 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1046  hypothetical protein  53.52 
 
 		 409 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3377  hypothetical protein  50.6 
 
 		 399 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0440  hypothetical protein  50.36 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1301  hypothetical protein  52.14 
 
 		 410 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3821  hypothetical protein  50.12 
 
 		 401 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3894  hypothetical protein  50.36 
 
 		 399 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4017  hypothetical protein  50.12 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1010  hypothetical protein  48.9 
 
 		 420 aa  414  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.75207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2392  hypothetical protein  49.53 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3286  SAM-dependent methyltransferase  35.75 
 
 		 378 aa  277  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3564  hypothetical protein  39.31 
 
 		 413 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0616674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0632  hypothetical protein  34.12 
 
 		 404 aa  259  7e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.95994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0414  SAM-dependent methyltransferase  36.19 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.675076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2883  hypothetical protein  30.86 
 
 		 400 aa  193  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46056  predicted protein  38.08 
 
 		 612 aa  191  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.268711  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3723  hypothetical protein  29.29 
 
 		 411 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0312  hypothetical protein  33.83 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0938935  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0726  hypothetical protein  31.74 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3589  hypothetical protein  33.33 
 
 		 401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2704 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0216  hypothetical protein  28.84 
 
 		 411 aa  179  7e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.380044  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1122  hypothetical protein  29.93 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.003942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1304  hypothetical protein  29.93 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00427648  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0378  hypothetical protein  33.17 
 
 		 401 aa  167  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3162  SAM dependent methyltransferase  30.6 
 
 		 389 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0449  hypothetical protein  33.93 
 
 		 392 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114768  decreased coverage  0.00000434601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5884  hypothetical protein  30.42 
 
 		 376 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87131  predicted protein  28.81 
 
 		 453 aa  149  7e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00012796  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2170  SAM dependent methyltransferase  29.52 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000185773  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2734  hypothetical protein  32.91 
 
 		 276 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1388  hypothetical protein  33.6 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2456  hypothetical protein  32.88 
 
 		 277 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0871  hypothetical protein  32.89 
 
 		 285 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1150  hypothetical protein  35.51 
 
 		 294 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1797  hypothetical protein  32.78 
 
 		 273 aa  113  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.534561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0625  hypothetical protein  33.61 
 
 		 316 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4127  hypothetical protein  35.8 
 
 		 283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1006  hypothetical protein  33.87 
 
 		 320 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3984  hypothetical protein  36.21 
 
 		 280 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1733  hypothetical protein  32.88 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0033  hypothetical protein  32.88 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3617  hypothetical protein  32.88 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3605  hypothetical protein  32.88 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3167  hypothetical protein  32.88 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2810  hypothetical protein  32.88 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2942  hypothetical protein  31 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3630  hypothetical protein  32.88 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4096  hypothetical protein  35.8 
 
 		 283 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0707  hypothetical protein  34.71 
 
 		 309 aa  109  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3581  hypothetical protein  33.61 
 
 		 323 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2900  hypothetical protein  31.17 
 
 		 296 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320076  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3535  hypothetical protein  30.77 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0781618  normal  0.194913 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1208  hypothetical protein  34.04 
 
 		 273 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3560  hypothetical protein  33.64 
 
 		 277 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215657  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0423  hypothetical protein  29.55 
 
 		 280 aa  106  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3601  hypothetical protein  32.5 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5571  hypothetical protein  29.39 
 
 		 290 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4678  hypothetical protein  32.5 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.998314 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0532  hypothetical protein  31.4 
 
 		 307 aa  104  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0470  hypothetical protein  31.72 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3585  hypothetical protein  31.28 
 
 		 295 aa  104  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0402  hypothetical protein  31.28 
 
 		 303 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0428  hypothetical protein  31.28 
 
 		 303 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2930  hypothetical protein  32.24 
 
 		 286 aa  103  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.778449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0497  hypothetical protein  31.28 
 
 		 296 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2608  hypothetical protein  31.28 
 
 		 296 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485441  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0436  hypothetical protein  37.2 
 
 		 277 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3157  hypothetical protein  30.8 
 
 		 278 aa  100  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0682  hypothetical protein  34.12 
 
 		 294 aa  99.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.189745  normal  0.58708 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50474  predicted protein  26.53 
 
 		 747 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0241823  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0302  hypothetical protein  29.94 
 
 		 401 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000220682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0279  hypothetical protein  27.39 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00141559  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.42 
 
 		 265 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.65 
 
 		 281 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0308  hypothetical protein  27.92 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000534116  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0297  hypothetical protein  27.39 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000071449  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1364  hypothetical protein  26.92 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1368  hypothetical protein  26.75 
 
 		 468 aa  47.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04300  hypothetical protein  27.78 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4931  hypothetical protein  25.9 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000903966  hitchhiker  0.000000101808 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93465  predicted protein  24.34 
 
 		 278 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00870525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4915  hypothetical protein  26.17 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0218003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 360 aa  43.9  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  43.5  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 273 aa  43.5  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>