80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0632 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0632  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  830    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.95994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0414  SAM-dependent methyltransferase  56.35 
 
 
394 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.675076  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3286  SAM-dependent methyltransferase  47.94 
 
 
378 aa  334  2e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3377  hypothetical protein  41.48 
 
 
399 aa  300  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3894  hypothetical protein  41.22 
 
 
399 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4017  hypothetical protein  41.22 
 
 
399 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3821  hypothetical protein  40.97 
 
 
401 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0440  hypothetical protein  40.97 
 
 
399 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1010  hypothetical protein  41.92 
 
 
420 aa  288  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.75207  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3988  hypothetical protein  38.5 
 
 
406 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4286  hypothetical protein  38.29 
 
 
406 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3564  hypothetical protein  37.14 
 
 
413 aa  283  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0616674  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4318  hypothetical protein  37.22 
 
 
404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234273  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1046  hypothetical protein  37.75 
 
 
409 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4406  hypothetical protein  37 
 
 
404 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1301  hypothetical protein  38.11 
 
 
410 aa  269  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3246  hypothetical protein  33.72 
 
 
444 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143918  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2392  hypothetical protein  34.68 
 
 
423 aa  249  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2883  hypothetical protein  35.83 
 
 
400 aa  204  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46056  predicted protein  38.69 
 
 
612 aa  194  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.268711  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3723  hypothetical protein  32.43 
 
 
411 aa  193  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0216  hypothetical protein  34.93 
 
 
411 aa  186  5e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.380044  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0312  hypothetical protein  28.18 
 
 
388 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0938935  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1304  hypothetical protein  35.4 
 
 
388 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00427648  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1122  hypothetical protein  35.04 
 
 
388 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.003942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3589  hypothetical protein  30.33 
 
 
401 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.2704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5884  hypothetical protein  28.81 
 
 
376 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2170  SAM dependent methyltransferase  34.51 
 
 
389 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000185773  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3162  SAM dependent methyltransferase  31.51 
 
 
389 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0726  hypothetical protein  27.66 
 
 
407 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0449  hypothetical protein  28.33 
 
 
392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114768  decreased coverage  0.00000434601 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0378  hypothetical protein  27.04 
 
 
401 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87131  predicted protein  29.82 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00012796  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2734  hypothetical protein  33.46 
 
 
276 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2456  hypothetical protein  33.92 
 
 
277 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0871  hypothetical protein  33.48 
 
 
285 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215269  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1150  hypothetical protein  30.1 
 
 
294 aa  129  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1388  hypothetical protein  32.35 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2942  hypothetical protein  32.6 
 
 
298 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3630  hypothetical protein  33.04 
 
 
300 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1733  hypothetical protein  33.04 
 
 
298 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2810  hypothetical protein  33.04 
 
 
298 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3167  hypothetical protein  33.04 
 
 
298 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0033  hypothetical protein  33.04 
 
 
298 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3617  hypothetical protein  33.04 
 
 
300 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3605  hypothetical protein  33.04 
 
 
300 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2930  hypothetical protein  31.28 
 
 
286 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.778449  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1006  hypothetical protein  31.74 
 
 
320 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4096  hypothetical protein  30.86 
 
 
283 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4127  hypothetical protein  30.37 
 
 
283 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3984  hypothetical protein  30.37 
 
 
280 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3601  hypothetical protein  33.62 
 
 
278 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4678  hypothetical protein  33.62 
 
 
278 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.998314 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1797  hypothetical protein  31.65 
 
 
273 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.534561 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3585  hypothetical protein  31.47 
 
 
295 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3535  hypothetical protein  32.17 
 
 
280 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0781618  normal  0.194913 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0532  hypothetical protein  32.03 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0470  hypothetical protein  32.62 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0423  hypothetical protein  32.17 
 
 
280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0625  hypothetical protein  30.08 
 
 
316 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629382  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0402  hypothetical protein  32.19 
 
 
303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0428  hypothetical protein  32.19 
 
 
303 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5571  hypothetical protein  30.4 
 
 
290 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0497  hypothetical protein  32.19 
 
 
296 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2608  hypothetical protein  32.19 
 
 
296 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485441  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3560  hypothetical protein  32.16 
 
 
277 aa  119  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2900  hypothetical protein  31.76 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320076  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3157  hypothetical protein  32.75 
 
 
278 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3581  hypothetical protein  29.7 
 
 
323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0682  hypothetical protein  30.83 
 
 
294 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.189745  normal  0.58708 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1208  hypothetical protein  32.02 
 
 
273 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0707  hypothetical protein  30.03 
 
 
309 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0436  hypothetical protein  30.54 
 
 
277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0935  hypothetical protein  36.73 
 
 
132 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44877  predicted protein  26.67 
 
 
476 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93465  predicted protein  26.25 
 
 
278 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00870525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4150  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1688  hypothetical protein  28.03 
 
 
396 aa  43.5  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.243841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
1039 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 
258 aa  43.1  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>